More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0040 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  100 
 
 
442 aa  888    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  56.97 
 
 
437 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  57.86 
 
 
438 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  54.61 
 
 
437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  56.12 
 
 
440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  56.97 
 
 
438 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  53.83 
 
 
441 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  52.05 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  52.18 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  52.94 
 
 
440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  54.14 
 
 
439 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  54.76 
 
 
442 aa  448  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  52.17 
 
 
433 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  52.04 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  52.78 
 
 
431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  53.22 
 
 
437 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  55.13 
 
 
442 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  54.44 
 
 
436 aa  438  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.08 
 
 
433 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  53.38 
 
 
442 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  51.02 
 
 
438 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  51.52 
 
 
427 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  51.8 
 
 
434 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  52.16 
 
 
441 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  55.34 
 
 
436 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  52.15 
 
 
439 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  53.48 
 
 
443 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  51.79 
 
 
434 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  51.56 
 
 
434 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  53.83 
 
 
426 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.52 
 
 
441 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  52.52 
 
 
443 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  52.04 
 
 
432 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  51.38 
 
 
439 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  53.96 
 
 
489 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  47.29 
 
 
442 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  53.18 
 
 
441 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  51.69 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  49.66 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.67 
 
 
454 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  49.65 
 
 
449 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  51.2 
 
 
443 aa  411  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  51.76 
 
 
435 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  48.97 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  51.82 
 
 
441 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.73 
 
 
461 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  51.07 
 
 
449 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.98 
 
 
439 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.77 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  51.2 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.73 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.24 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.49 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.73 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  48.51 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.6 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  49.44 
 
 
442 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  51.17 
 
 
429 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  50.57 
 
 
449 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  50.58 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  50.35 
 
 
440 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  48.28 
 
 
435 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  49.66 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  50.57 
 
 
443 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  50.49 
 
 
458 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  49.44 
 
 
442 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  49.44 
 
 
442 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  50.82 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  50.34 
 
 
449 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.9 
 
 
450 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  50.23 
 
 
443 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  52.05 
 
 
463 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  47.03 
 
 
504 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  52.05 
 
 
463 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  47.07 
 
 
485 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  51.16 
 
 
437 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  45.21 
 
 
436 aa  379  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  49 
 
 
468 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.66 
 
 
449 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.29 
 
 
480 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  50.11 
 
 
460 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  47.61 
 
 
463 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.42 
 
 
449 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  44.66 
 
 
478 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  48.92 
 
 
443 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  43.64 
 
 
446 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  48.1 
 
 
445 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  47.02 
 
 
454 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  46.74 
 
 
486 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  48.34 
 
 
445 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  48.1 
 
 
445 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.53 
 
 
452 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  47.53 
 
 
452 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  47.39 
 
 
452 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  45.33 
 
 
446 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  45.31 
 
 
445 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 
443 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  46.35 
 
 
441 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  48.07 
 
 
429 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  47.47 
 
 
443 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>