More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0032 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0032  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
605 aa  1238    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2245  DNA topoisomerase IV subunit B  53.06 
 
 
605 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.805045  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0036  DNA topoisomerase IV subunit B  52.66 
 
 
599 aa  615  1e-175  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2768  DNA topoisomerase IV subunit B  51.07 
 
 
623 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.773452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2473  DNA topoisomerase IV subunit B  50.65 
 
 
622 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09718  DNA topoisomerase IV subunit B  49.51 
 
 
618 aa  581  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1614  DNA topoisomerase IV subunit B  50.57 
 
 
628 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218191  normal  0.0551388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2083  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
616 aa  578  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173005  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0648  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 
626 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0105  DNA topoisomerase IV subunit B  47.6 
 
 
629 aa  566  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3475  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 
633 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2567  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain protein  47.5 
 
 
632 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3105  DNA topoisomerase IV subunit B  48.29 
 
 
640 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1194  DNA topoisomerase IV subunit B  46.15 
 
 
613 aa  541  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000381056  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0368  DNA topoisomerase IV subunit B  44.9 
 
 
644 aa  535  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.550599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  31.94 
 
 
651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  31.5 
 
 
636 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  32.39 
 
 
650 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  30.65 
 
 
654 aa  300  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  31.12 
 
 
652 aa  299  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  31.18 
 
 
636 aa  296  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  31.6 
 
 
640 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  30.65 
 
 
659 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  32.66 
 
 
637 aa  292  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  30.38 
 
 
636 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  32.18 
 
 
660 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  29.52 
 
 
645 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  30.53 
 
 
649 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  32.7 
 
 
627 aa  288  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  31.33 
 
 
628 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  31.42 
 
 
648 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  30.31 
 
 
644 aa  286  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  30.91 
 
 
633 aa  286  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  31.72 
 
 
642 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  32.13 
 
 
638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  30.65 
 
 
651 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  30.69 
 
 
656 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  30.81 
 
 
633 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  31.11 
 
 
719 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  30.43 
 
 
633 aa  283  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  31.16 
 
 
640 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  30.74 
 
 
632 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  29.69 
 
 
637 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  29.89 
 
 
646 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  31.73 
 
 
655 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  29.78 
 
 
643 aa  281  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  30.24 
 
 
637 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  31.18 
 
 
634 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  30.5 
 
 
641 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  29.84 
 
 
643 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  29.64 
 
 
637 aa  277  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  31.8 
 
 
641 aa  277  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  30.62 
 
 
652 aa  277  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  29.28 
 
 
658 aa  277  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  30.63 
 
 
647 aa  276  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  29.2 
 
 
644 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  31.73 
 
 
658 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  30.55 
 
 
642 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  31.75 
 
 
635 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  31.35 
 
 
634 aa  274  4.0000000000000004e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  31.23 
 
 
635 aa  273  5.000000000000001e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  32.04 
 
 
638 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  32.04 
 
 
638 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  31.1 
 
 
651 aa  273  6e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  31.27 
 
 
655 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  29.26 
 
 
644 aa  273  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  30.96 
 
 
634 aa  272  1e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  30.16 
 
 
642 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  31.68 
 
 
655 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  31.78 
 
 
642 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.47 
 
 
641 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  29.08 
 
 
638 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  29.17 
 
 
649 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  31.38 
 
 
655 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  31.03 
 
 
636 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  31.31 
 
 
655 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  31.71 
 
 
635 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  29.1 
 
 
644 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  30.89 
 
 
645 aa  269  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.95 
 
 
633 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  31.53 
 
 
645 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  29.29 
 
 
644 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  29.57 
 
 
665 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  28.47 
 
 
675 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  29.01 
 
 
666 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  31.29 
 
 
649 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  28.86 
 
 
636 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  31.16 
 
 
655 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  29.73 
 
 
635 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  30.83 
 
 
661 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  29.22 
 
 
643 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  32.04 
 
 
655 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  29.7 
 
 
656 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  30.87 
 
 
644 aa  266  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  29.77 
 
 
678 aa  265  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  29.71 
 
 
645 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  29.85 
 
 
686 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  30.1 
 
 
650 aa  265  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  31.52 
 
 
655 aa  265  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  31.9 
 
 
648 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>