More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0031 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 490 aa  1004    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  42.34 
 
 		 703 aa  363  5.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  40.09 
 
 		 626 aa  362  1e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.77 
 
 		 697 aa  351  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.65 
 
 		 708 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  40.33 
 
 		 898 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  40.43 
 
 		 846 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  40.76 
 
 		 832 aa  332  9e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  40.95 
 
 		 859 aa  332  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  38.8 
 
 		 904 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  38.97 
 
 		 914 aa  322  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  39.79 
 
 		 897 aa  319  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  39.61 
 
 		 864 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  37.5 
 
 		 906 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  39.78 
 
 		 977 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  32.6 
 
 		 841 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  35.49 
 
 		 834 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0436  DNA gyrase A subunit  31.54 
 
 		 806 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000308081  normal  0.060965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2474  DNA gyrase, A subunit  31.98 
 
 		 805 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000172995  decreased coverage  0.00702489 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0413  DNA gyrase subunit A  34.47 
 
 		 824 aa  183  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0903108  decreased coverage  0.000217687 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  34.9 
 
 		 928 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  34.74 
 
 		 848 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  37.46 
 
 		 806 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  29.09 
 
 		 837 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  34.52 
 
 		 927 aa  177  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1512  DNA gyrase, A subunit  35.57 
 
 		 809 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.257014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  30.26 
 
 		 831 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  35.56 
 
 		 822 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1630  DNA gyrase, A subunit  35.57 
 
 		 809 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  29.63 
 
 		 865 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  34.56 
 
 		 825 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  35.92 
 
 		 838 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  34.11 
 
 		 922 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  35.14 
 
 		 836 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  34.11 
 
 		 934 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 818 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  35.96 
 
 		 817 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  30.63 
 
 		 813 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.768882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1375  DNA gyrase subunit A  35.28 
 
 		 809 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  31.43 
 
 		 827 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  33.53 
 
 		 923 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  29.58 
 
 		 839 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28121  predicted protein  29.58 
 
 		 897 aa  171  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0542452  normal  0.0190346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  34.9 
 
 		 853 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  31.94 
 
 		 856 aa  170  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  29.8 
 
 		 839 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1733  DNA gyrase, A subunit  36.83 
 
 		 804 aa  169  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.28256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1332  DNA topoisomerase IV subunit A  27.78 
 
 		 827 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  33.5 
 
 		 848 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  35.19 
 
 		 852 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1660  DNA gyrase, A subunit  36.83 
 
 		 804 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00811487  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  29.98 
 
 		 813 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  33.14 
 
 		 877 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0795  DNA gyrase, A subunit  37.38 
 
 		 823 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  32.25 
 
 		 907 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1072  DNA gyrase subunit A  31.91 
 
 		 915 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2949  DNA topoisomerase IV subunit A  33.82 
 
 		 826 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0430579  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1114  DNA gyrase, A subunit  34.9 
 
 		 898 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37334 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  29.54 
 
 		 813 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  29.49 
 
 		 834 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  32.65 
 
 		 856 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  35.38 
 
 		 802 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  30.53 
 
 		 814 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  29.54 
 
 		 820 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00041  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  27.58 
 
 		 827 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.885734 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf662  DNA gyrase subunit A  33.25 
 
 		 898 aa  167  5e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  32.28 
 
 		 848 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  36.79 
 
 		 818 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  27.27 
 
 		 840 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  33.6 
 
 		 883 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  32.35 
 
 		 846 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  30.23 
 
 		 882 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  32.84 
 
 		 848 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  32.84 
 
 		 878 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  29.21 
 
 		 829 aa  166  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0007  DNA gyrase subunit A  31.47 
 
 		 885 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.743623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  32.88 
 
 		 863 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  34.88 
 
 		 929 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  31.33 
 
 		 881 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  31.7 
 
 		 821 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  35.53 
 
 		 827 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  35.19 
 
 		 819 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  29.64 
 
 		 836 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0828  hypothetical protein  33.53 
 
 		 816 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.725746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0007  DNA gyrase subunit A  35.95 
 
 		 910 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1918  DNA gyrase subunit A  30.82 
 
 		 908 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0264462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0328  DNA gyrase, A subunit  35.76 
 
 		 823 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  32.35 
 
 		 830 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11691  DNA gyrase subunit A  32.61 
 
 		 865 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  33.14 
 
 		 879 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0821  DNA gyrase, A subunit  33.43 
 
 		 788 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0472642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  34.28 
 
 		 870 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  31.7 
 
 		 823 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  30.04 
 
 		 879 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  34.41 
 
 		 908 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0005  DNA topoisomerase IV subunit A  28.94 
 
 		 813 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.44739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  33.63 
 
 		 915 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2799  DNA gyrase subunit A  32.55 
 
 		 888 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107498  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  30.96 
 
 		 823 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  30.96 
 
 		 823 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>