More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0019 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0019  recombinase A  100 
 
 		 354 aa  717    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.112169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  59.77 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  59.77 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  62.24 
 
 		 336 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.98 
 
 		 418 aa  434  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  61.63 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  60.96 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  60.54 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  59.59 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  61.47 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  62.73 
 
 		 379 aa  431  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  61.7 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  59.29 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  62.96 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  58.06 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  62.31 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  60.71 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  59.45 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  60.62 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  60.37 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  62.54 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  60.78 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  62.15 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  60.87 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  60.18 
 
 		 378 aa  425  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  59.15 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  61.26 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  59.94 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  61.08 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  59.52 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  59.05 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  61.59 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  61.21 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  58.58 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  60.86 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  59.65 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  58.86 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  58.62 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  61.26 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  59.63 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  61.59 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  61.47 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  61.7 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  60.31 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  64.09 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  60 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  61.28 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  59.88 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  58.81 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  60.43 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  58.93 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  60.12 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  60.74 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  60.67 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  60.49 
 
 		 364 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  60.74 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  61.16 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  57.97 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  59.48 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  62.15 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  61.21 
 
 		 376 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  60.74 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  56.48 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  63.55 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  57.77 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  61.37 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  59.08 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  61.13 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  63.58 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  59.38 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  59.69 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  60 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  58.93 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  58.93 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  59.45 
 
 		 350 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  59.33 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.37 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  60 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  60.12 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  59.69 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  58.68 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  60.31 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  58.63 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  60.12 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  57.27 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  62.94 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  60.31 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  58.46 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  58.46 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  62.62 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  61.61 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  59.64 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  62.26 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  56.2 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  57.76 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  61.99 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  60.69 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  55.91 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  58.66 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  58.05 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>