More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0004 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0004  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 714 aa  1449    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0132  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  24.25 
 
 		 901 aa  133  1.0000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0531  GreA/GreB family elongation factor  23.1 
 
 		 615 aa  126  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4032  GreA/GreB family elongation factor  23.3 
 
 		 616 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2695  transcript cleavage factor/unknown domain fusion protein  22.59 
 
 		 901 aa  103  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  32.41 
 
 		 161 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  33.09 
 
 		 160 aa  75.9  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  32.39 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  31.29 
 
 		 161 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  31.03 
 
 		 159 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 162 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  32.61 
 
 		 157 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  30.6 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  29.41 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  32.06 
 
 		 169 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 157 aa  69.7  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  34.65 
 
 		 161 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 152 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  28.89 
 
 		 167 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  34.55 
 
 		 161 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  32.37 
 
 		 163 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  30.77 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  34.35 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  31.47 
 
 		 162 aa  68.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2295  transcription elongation factor GreB  30.6 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  37.1 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  31.82 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2561  transcription elongation factor GreB  29.01 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.01679  hitchhiker  0.00000000000012211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27130  transcription elongation factor GreB  30.6 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  31.43 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  31.97 
 
 		 158 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  31.97 
 
 		 158 aa  67.4  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  31.97 
 
 		 158 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4017  transcription elongation factor GreB  28.36 
 
 		 165 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11479  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  31.97 
 
 		 158 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  29.25 
 
 		 157 aa  67  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  34.07 
 
 		 158 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  36.29 
 
 		 158 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  32.54 
 
 		 161 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  30.43 
 
 		 167 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  30.3 
 
 		 157 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  30.34 
 
 		 160 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  29.85 
 
 		 157 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  31.62 
 
 		 159 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  28.06 
 
 		 162 aa  66.2  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  35.85 
 
 		 160 aa  66.6  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23040  transcription elongation factor GreB  28.24 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  34.09 
 
 		 156 aa  65.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  27.78 
 
 		 167 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  34.56 
 
 		 175 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  29.41 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  32.43 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  29.11 
 
 		 166 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0731  GreA/GreB family elongation factor  28.24 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000249638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  36.79 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  32.86 
 
 		 164 aa  65.1  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0171  transcription elongation factor GreB  27.94 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3981  transcription elongation factor GreB  27.94 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  34.4 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  28.46 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0718  GreA/GreB family elongation factor  28.24 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.188728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  37.74 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  32.58 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  30.94 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  31.75 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  31.11 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  31.11 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  31.11 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  31.75 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  29.55 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  31.54 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  31.75 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  30.99 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  31.75 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1201  transcription elongation factor GreB  27.07 
 
 		 161 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0727535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  31.06 
 
 		 161 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  34.4 
 
 		 175 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  32.58 
 
 		 156 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  32.58 
 
 		 156 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  35.19 
 
 		 171 aa  63.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  31.06 
 
 		 157 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  31.25 
 
 		 162 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2558  GreA/GreB family elongation factor  26.45 
 
 		 178 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3307  transcription elongation factor GreB  29.77 
 
 		 157 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000320561  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  31.34 
 
 		 156 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  39.81 
 
 		 160 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  27.94 
 
 		 160 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0515  GreA/GreB family elongation factor  30.08 
 
 		 154 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000042647  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  31.06 
 
 		 165 aa  62.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0397  GreA/GreB family elongation factor  36.21 
 
 		 156 aa  62.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0103931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  29.2 
 
 		 161 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  30.3 
 
 		 156 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1494  transcription elongation factor GreB  29.32 
 
 		 158 aa  62.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  29.69 
 
 		 157 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  30.15 
 
 		 159 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 154 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>