150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_14028 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_14028  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.989e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0033  tRNA-Arg  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  94.52 
 
 
74 bp  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  91.89 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  92.42 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0012  tRNA-Arg  92.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0033  tRNA-Arg  89.04 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  91.23 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  88.41 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  88.06 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  89.66 
 
 
76 bp  67.9  3e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  87.88 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  2.47527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  87.88 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.20516e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  89.66 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.75321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0009  tRNA-Arg  93.18 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  1.52408e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0024  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.242795  normal  0.395578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0030  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  60  7e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.83529e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  91.3 
 
 
76 bp  60  7e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  7e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  88.68 
 
 
79 bp  58  3e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.13688e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.91538e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  88.68 
 
 
79 bp  58  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1397  tRNA-Arg  87.72 
 
 
73 bp  58  3e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  56  1e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.00461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  56  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.94 
 
 
74 bp  56  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.27256e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.00399e-07  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  54  5e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.71008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  5e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  84.85 
 
 
77 bp  52  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0049  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  2e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  84.29 
 
 
74 bp  52  2e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  90.48 
 
 
74 bp  52  2e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  2e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  86.36 
 
 
76 bp  52  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  84.85 
 
 
74 bp  52  2e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  2e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  3.59807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  86.36 
 
 
73 bp  52  2e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  87.04 
 
 
76 bp  52  2e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.97698e-05  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  84.85 
 
 
77 bp  52  2e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  90.48 
 
 
80 bp  52  2e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  85.71 
 
 
73 bp  52  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  2e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  84.93 
 
 
73 bp  50.1  7e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  7.05596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.50994e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  84.06 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  85.51 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  93.94 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  6.31385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  84.62 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.0989e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  84.06 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  93.94 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.78277e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.34564e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  6.81563e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.38552e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>