81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13923 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  36.18 
 
 
319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  36.18 
 
 
319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  36.18 
 
 
319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  37.5 
 
 
532 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  38.54 
 
 
390 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  35.2 
 
 
380 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  35.21 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  34.26 
 
 
418 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  32.35 
 
 
405 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  33.44 
 
 
364 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  35.03 
 
 
343 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 
478 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  30.67 
 
 
388 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  30.67 
 
 
388 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  30.67 
 
 
388 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  33.57 
 
 
771 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  33.22 
 
 
495 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  30.67 
 
 
362 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  33 
 
 
639 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  31.62 
 
 
463 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  31.72 
 
 
899 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  29.9 
 
 
455 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  31.92 
 
 
346 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  31.74 
 
 
425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  31.27 
 
 
475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  29.39 
 
 
414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  31.27 
 
 
475 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  30.87 
 
 
665 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  31.27 
 
 
475 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  32.16 
 
 
759 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  30.61 
 
 
666 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.4 
 
 
552 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  31.02 
 
 
330 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  30.56 
 
 
619 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.44 
 
 
698 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  27.95 
 
 
587 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.69 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  26.07 
 
 
453 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  24.5 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  27.44 
 
 
534 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  28.62 
 
 
1160 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  25.41 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.1 
 
 
544 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  26.56 
 
 
1132 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  25.93 
 
 
617 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  24.25 
 
 
579 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  28.76 
 
 
811 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  26.47 
 
 
926 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.66 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  25.67 
 
 
968 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  23.46 
 
 
586 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.18 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  23.36 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.68 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  27.33 
 
 
474 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  27.43 
 
 
1519 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.57 
 
 
398 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  27.33 
 
 
487 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.67 
 
 
397 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.48 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.7 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.82 
 
 
223 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.82 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  24.84 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.68 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.72 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  25.1 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0721  chromosome partitioning ATPase  25 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20.77 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.13 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  27.78 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  26.39 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  27.08 
 
 
422 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  24.81 
 
 
544 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.74 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.08 
 
 
423 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  26.23 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  23.55 
 
 
422 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.68 
 
 
402 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>