55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13856 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  799    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  42.05 
 
 
359 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  38.04 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  41.73 
 
 
380 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  40.73 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  40.73 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  40.73 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  33.56 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  38.38 
 
 
479 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  31.4 
 
 
423 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  35.29 
 
 
435 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  35.61 
 
 
307 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  35.61 
 
 
307 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  35.61 
 
 
307 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  33.05 
 
 
448 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  35.4 
 
 
416 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  33.18 
 
 
413 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  34.39 
 
 
528 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  34.75 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  31.2 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  31.62 
 
 
499 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  30.8 
 
 
655 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  30.8 
 
 
588 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  32.06 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  29.43 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  28.14 
 
 
502 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  28.57 
 
 
533 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  29.61 
 
 
580 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  30.59 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  28.88 
 
 
427 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  27.08 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  27.08 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  27.08 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  29.74 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  37.17 
 
 
768 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  27.67 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  27.67 
 
 
517 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  28.91 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  29.78 
 
 
529 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  28.91 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  29.78 
 
 
529 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  28.91 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  29.1 
 
 
533 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  27.02 
 
 
517 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  32.55 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  31.34 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  29.78 
 
 
527 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  26.02 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  28.57 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  23.65 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  27.7 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  27.22 
 
 
518 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  30 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  28.85 
 
 
526 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>