46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13782 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  51.35 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  48.6 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  51.96 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  48.11 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  47.66 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  42 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  52.44 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  39.32 
 
 		 154 aa  83.6  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  41.49 
 
 		 156 aa  83.6  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  41.49 
 
 		 156 aa  83.6  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  39.32 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  38.61 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  39.66 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  41.84 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  41.49 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  39.8 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  40.7 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  50.7 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  42.71 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  42.68 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  36.84 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  39.36 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  46.38 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  34.04 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  32.67 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  35.79 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  30 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  56.76 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  32.2 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>