48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13771 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  100 
 
 
77 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  74.03 
 
 
513 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  74.03 
 
 
434 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  74.03 
 
 
435 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  67.12 
 
 
518 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  68.83 
 
 
556 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  76.62 
 
 
525 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  76.62 
 
 
525 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  76.62 
 
 
525 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  72.73 
 
 
524 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  71.23 
 
 
536 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  70.13 
 
 
540 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  52.7 
 
 
452 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  52.7 
 
 
452 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  57.75 
 
 
463 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  57.33 
 
 
496 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  48.05 
 
 
539 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  42.65 
 
 
3295 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  44.12 
 
 
1457 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  47.14 
 
 
396 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  44.16 
 
 
487 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  47.06 
 
 
392 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  40.91 
 
 
760 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  41.18 
 
 
443 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  47.06 
 
 
391 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  45.83 
 
 
368 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  49.06 
 
 
975 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  42.31 
 
 
403 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  46.43 
 
 
1013 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  42.47 
 
 
443 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  42.47 
 
 
443 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  42.47 
 
 
443 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  39.39 
 
 
645 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  41.18 
 
 
385 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  45.07 
 
 
448 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  38.57 
 
 
394 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  39.13 
 
 
194 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  42.65 
 
 
393 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  47.76 
 
 
406 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  39.71 
 
 
580 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  36.99 
 
 
439 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  41.79 
 
 
391 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  40.74 
 
 
551 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  39.71 
 
 
423 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  44.78 
 
 
380 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  34.25 
 
 
436 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  38.57 
 
 
350 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  38.57 
 
 
350 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>