38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13770 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  100 
 
 
315 aa  597  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  43.55 
 
 
435 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  65.66 
 
 
434 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  41.46 
 
 
540 aa  117  4e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  68.89 
 
 
556 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  41.34 
 
 
496 aa  113  4e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  41.38 
 
 
513 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  78.26 
 
 
536 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  59.21 
 
 
518 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  41.67 
 
 
463 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  55.56 
 
 
539 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.93928e-11  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  80.77 
 
 
525 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  80.77 
 
 
525 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  80.77 
 
 
525 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  74.55 
 
 
524 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  50.65 
 
 
452 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  50.65 
 
 
452 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  46.58 
 
 
443 aa  73.6  4e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  46.58 
 
 
443 aa  73.6  4e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  46.58 
 
 
443 aa  73.6  4e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  65.38 
 
 
368 aa  73.2  5e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  60.78 
 
 
439 aa  72.8  7e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  52.46 
 
 
436 aa  72.4  1e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  48.05 
 
 
445 aa  70.5  4e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  52.73 
 
 
450 aa  63.9  3e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  49.15 
 
 
406 aa  50.1  5e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  8.59509e-09 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  43.08 
 
 
423 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  40.4 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  36.36 
 
 
394 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  41.89 
 
 
409 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  48 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  37.86 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  44.26 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  41.67 
 
 
213 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  48 
 
 
443 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.54935e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  55.26 
 
 
413 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  44.44 
 
 
396 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  46.67 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>