63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13765 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 
163 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  65.33 
 
 
157 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  65.33 
 
 
157 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  65.33 
 
 
157 aa  201  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  56 
 
 
154 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  53.95 
 
 
155 aa  166  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  54.73 
 
 
155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 
160 aa  161  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 
174 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 
155 aa  157  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  48.8 
 
 
172 aa  157  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 
153 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
162 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 
154 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
160 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
163 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 
162 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 
155 aa  148  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
152 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
156 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 
154 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
168 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  50.7 
 
 
154 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 
153 aa  140  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 
155 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  54.05 
 
 
154 aa  140  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
154 aa  140  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  47.8 
 
 
165 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
154 aa  130  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
154 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
324 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
162 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  33.03 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  30 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
149 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  31.93 
 
 
157 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.6 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  31.93 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  31.93 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.03 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  33.03 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  33.03 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  31.93 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  30.71 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
201 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
324 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  23.94 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
296 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>