More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13760 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  63.79 
 
 		 1048 aa  1144    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  100 
 
 		 1065 aa  2078    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.42 
 
 		 531 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0155  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.93 
 
 		 487 aa  265  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4115  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 468 aa  265  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.976029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1939  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 477 aa  248  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0278  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 		 467 aa  240  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 607 aa  237  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  34.09 
 
 		 583 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 522 aa  221  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 		 514 aa  221  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 522 aa  221  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 		 489 aa  220  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 478 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.68 
 
 		 515 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 		 489 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.67 
 
 		 498 aa  208  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.29 
 
 		 502 aa  207  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 527 aa  204  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.17 
 
 		 468 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 483 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 483 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 528 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 		 763 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 480 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 		 516 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 512 aa  195  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 521 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 		 540 aa  194  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 514 aa  194  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.55 
 
 		 474 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.56 
 
 		 522 aa  194  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  32.93 
 
 		 554 aa  193  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 509 aa  193  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 500 aa  193  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.58 
 
 		 469 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 510 aa  193  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 		 485 aa  192  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 468 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 468 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 		 500 aa  191  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  29.64 
 
 		 582 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 502 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 585 aa  189  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  29.4 
 
 		 582 aa  188  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.03 
 
 		 478 aa  188  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 490 aa  188  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  30.12 
 
 		 582 aa  187  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 488 aa  187  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 581 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 		 492 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 		 584 aa  187  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 524 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  29.64 
 
 		 582 aa  186  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 		 486 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 583 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 397 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 498 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 487 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 508 aa  183  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.87 
 
 		 504 aa  183  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 		 504 aa  183  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 480 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 534 aa  182  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.76 
 
 		 471 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.98 
 
 		 613 aa  182  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 507 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  37.93 
 
 		 537 aa  181  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 515 aa  181  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 452 aa  180  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 480 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 579 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 627 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 609 aa  178  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 487 aa  178  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 		 534 aa  178  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0420  major facilitator superfamily permease  30.26 
 
 		 608 aa  177  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 		 534 aa  177  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 		 458 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 484 aa  177  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.8 
 
 		 511 aa  176  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 		 520 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 486 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 486 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  30.48 
 
 		 568 aa  175  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.36 
 
 		 476 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 583 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 463 aa  176  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 486 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 486 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
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NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 486 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 465 aa  176  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 486 aa  176  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 		 508 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
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NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 465 aa  174  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 		 521 aa  174  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 564 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 505 aa  174  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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