52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13690 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  53.6 
 
 
365 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  52.62 
 
 
365 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  60 
 
 
353 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  60 
 
 
353 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  60 
 
 
353 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  49.68 
 
 
355 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  43.8 
 
 
359 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  42.48 
 
 
352 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  38.25 
 
 
364 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  44.41 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  45.22 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  40.48 
 
 
366 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  35.1 
 
 
369 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  39.52 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  36.28 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  36.56 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  40.06 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  36.08 
 
 
364 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  43.3 
 
 
357 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  45.03 
 
 
569 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  34.96 
 
 
348 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  30.47 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  30.51 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  36.36 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  35.06 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  38.35 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  30.12 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  39.52 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  23.74 
 
 
580 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  29.08 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  26.58 
 
 
422 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  29.48 
 
 
587 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  31.87 
 
 
309 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  32.37 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  29.26 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.37 
 
 
377 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  23.83 
 
 
269 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.22 
 
 
423 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.46 
 
 
414 aa  46.6  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  27.22 
 
 
422 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.69 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  23.79 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  23.53 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0952  hypothetical protein  27.14 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  23.41 
 
 
269 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  34.65 
 
 
402 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  26.63 
 
 
422 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  28.38 
 
 
271 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  26.63 
 
 
425 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 
423 aa  42.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  36.54 
 
 
229 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>