More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13678 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  48.78 
 
 
795 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.42 
 
 
775 aa  917    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.49 
 
 
761 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  46.86 
 
 
833 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.64 
 
 
815 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.32 
 
 
824 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  61.67 
 
 
795 aa  919    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  53.66 
 
 
804 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.31 
 
 
790 aa  694    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.02 
 
 
812 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.03 
 
 
807 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.25 
 
 
848 aa  722    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.65 
 
 
802 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  76.55 
 
 
775 aa  1138    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  58.02 
 
 
798 aa  826    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.65 
 
 
804 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.99 
 
 
764 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.59 
 
 
781 aa  1159    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.87 
 
 
806 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.57 
 
 
778 aa  733    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.58 
 
 
815 aa  714    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.35 
 
 
807 aa  704    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.55 
 
 
775 aa  1138    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.3 
 
 
782 aa  1129    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.55 
 
 
775 aa  1139    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  100 
 
 
771 aa  1530    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.87 
 
 
763 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  51.33 
 
 
865 aa  671    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  43.56 
 
 
891 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.09 
 
 
861 aa  627  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  48.47 
 
 
780 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.15 
 
 
868 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.27 
 
 
803 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.34 
 
 
764 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.57 
 
 
764 aa  568  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.96 
 
 
764 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  43.7 
 
 
862 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.6 
 
 
868 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  42.38 
 
 
761 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  53.18 
 
 
866 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.03 
 
 
1053 aa  482  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  36.98 
 
 
912 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.86 
 
 
768 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.97 
 
 
1198 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.85 
 
 
764 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  39.32 
 
 
986 aa  465  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  41.3 
 
 
797 aa  465  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 
762 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.31 
 
 
773 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.07 
 
 
962 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.65 
 
 
973 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.11 
 
 
941 aa  450  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.67 
 
 
739 aa  452  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  37.15 
 
 
751 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
959 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.53 
 
 
902 aa  446  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.29 
 
 
1086 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.09 
 
 
807 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.52 
 
 
972 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.3 
 
 
753 aa  429  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.63 
 
 
752 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  36.71 
 
 
738 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.67 
 
 
759 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.39 
 
 
758 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.61 
 
 
751 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.1 
 
 
790 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.02 
 
 
896 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.22 
 
 
789 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.8 
 
 
808 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  34.94 
 
 
815 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.08 
 
 
805 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.97 
 
 
829 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  33.89 
 
 
831 aa  363  9e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
685 aa  355  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  31.31 
 
 
1210 aa  351  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.49 
 
 
855 aa  340  9e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.44 
 
 
838 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.18 
 
 
803 aa  303  9e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  31.71 
 
 
758 aa  301  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
744 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  28.32 
 
 
1178 aa  285  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
897 aa  277  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  31.69 
 
 
948 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
744 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  30.47 
 
 
931 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.62 
 
 
766 aa  265  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
756 aa  264  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.41 
 
 
744 aa  257  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 
744 aa  253  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.44 
 
 
751 aa  245  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
740 aa  239  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.05 
 
 
739 aa  233  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.49 
 
 
815 aa  229  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 
905 aa  215  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.76 
 
 
876 aa  183  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  22.03 
 
 
906 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.44 
 
 
914 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.42 
 
 
911 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.82 
 
 
879 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2740  helicase domain-containing protein  42.41 
 
 
468 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>