56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13664 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.37 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.82 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.6 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.82 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.67 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.67 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  36.08 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.95 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.65 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.53 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  28.83 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  29.34 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.35 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.5 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  27.01 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.19 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.3 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  34.18 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.46 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  26.51 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.48 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.29 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  27.71 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  29.11 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  26.4 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  24.9 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  35.17 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  26.36 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  31.17 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.12 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.3 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.21 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4193  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.71 
 
 		 681 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.1 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.1 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0162  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.63 
 
 		 681 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  34.74 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.62 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.39 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  32.17 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1922  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.88 
 
 		 390 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.6 
 
 		 372 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00020  expressed protein  24.63 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>