More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13648 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  100 
 
 
322 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  67.08 
 
 
315 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  67.08 
 
 
315 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  66.77 
 
 
341 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  62.34 
 
 
337 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  62.97 
 
 
312 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
315 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  47.47 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  46.37 
 
 
315 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  45.94 
 
 
328 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  48.43 
 
 
323 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  47.77 
 
 
311 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  45.51 
 
 
317 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 
314 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
323 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  48.14 
 
 
302 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 
323 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  43.2 
 
 
334 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
323 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  41.72 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 
324 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 
331 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  44.65 
 
 
330 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  41.01 
 
 
315 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  42.68 
 
 
316 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 
344 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
323 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  38.18 
 
 
356 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
351 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.38 
 
 
350 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
351 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  33.43 
 
 
345 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
283 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
328 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
293 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
288 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
308 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
434 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.51 
 
 
293 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 
304 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
288 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
376 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
301 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  30.79 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  32.6 
 
 
356 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
367 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
308 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  34.17 
 
 
494 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
288 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
390 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
308 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  30.08 
 
 
371 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
284 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  31.33 
 
 
311 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
274 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
287 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
288 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
281 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
307 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.11 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.99 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  34.5 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
309 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>