More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13612 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13612  tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.288349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  78.53 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  77.56 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5122  RNA methyltransferase  78.27 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4736  RNA methyltransferase TrmH, group 3  77.96 
 
 		 314 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  70.16 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4822  RNA methyltransferase  77.96 
 
 		 314 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945978  normal  0.837173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  67.29 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  63.32 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  61.44 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  62.25 
 
 		 312 aa  338  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  58.31 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.59 
 
 		 321 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  58.41 
 
 		 314 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.8 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.72 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  54.49 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  53.27 
 
 		 339 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.38 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  49.46 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.65 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  55.11 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.53 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  49.38 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  61.75 
 
 		 373 aa  291  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  53.46 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.47 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.56 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8152  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.08 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  58.85 
 
 		 386 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  51.27 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.27 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03800  rRNA methylase, putative, group 3  48.99 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.395862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.56 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  44.27 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0353  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  48.61 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  47.13 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.42 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.56 
 
 		 249 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  41.22 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  37.28 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.59 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.5 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.53 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  40.41 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.26 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.51 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.87 
 
 		 246 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.78 
 
 		 247 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.18 
 
 		 247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 243 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.44 
 
 		 542 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  36.19 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.66 
 
 		 246 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  40.91 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.06 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.57 
 
 		 652 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.74 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 249 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.42 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  41.08 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  40.91 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  40.56 
 
 		 256 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.16 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.02 
 
 		 234 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.11 
 
 		 387 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.8 
 
 		 254 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  40.66 
 
 		 536 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  32.45 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  36.89 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  42.8 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  36.89 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.9 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.9 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.27 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.51 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  36.19 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.2 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.66 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  36.61 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.87 
 
 		 247 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.59 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.22 
 
 		 416 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  35.08 
 
 		 249 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.22 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.37 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  40.82 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  38.93 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.15 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>