125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13575 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  75.87 
 
 
324 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  74.12 
 
 
317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  72.2 
 
 
317 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  71.79 
 
 
318 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  71.79 
 
 
318 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  65.55 
 
 
333 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  55.45 
 
 
322 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  50.63 
 
 
315 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  52.58 
 
 
305 aa  279  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  47.13 
 
 
319 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  45.96 
 
 
312 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  39.73 
 
 
319 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  37.95 
 
 
321 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  44.24 
 
 
177 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  49.7 
 
 
173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  45.31 
 
 
132 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  40.18 
 
 
143 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  38.05 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  41.94 
 
 
137 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  34.71 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  40.71 
 
 
138 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.63 
 
 
136 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  35.9 
 
 
132 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  39.32 
 
 
120 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.82 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.01 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.57 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.63 
 
 
136 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.82 
 
 
550 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  37.84 
 
 
141 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.93 
 
 
550 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.93 
 
 
550 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  29.91 
 
 
136 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  42.53 
 
 
121 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  36.36 
 
 
140 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  36.13 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.82 
 
 
138 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  33.93 
 
 
135 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  35.2 
 
 
541 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  40.51 
 
 
121 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.82 
 
 
138 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.82 
 
 
138 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  34.62 
 
 
136 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.48 
 
 
133 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.07 
 
 
143 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  31.2 
 
 
548 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.04 
 
 
548 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.46 
 
 
137 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  33.59 
 
 
140 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.36 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  30 
 
 
135 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  32.19 
 
 
146 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  30.88 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  30.88 
 
 
150 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.09 
 
 
143 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  32.35 
 
 
147 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  45.16 
 
 
148 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  26.28 
 
 
147 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  32.76 
 
 
142 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  30.15 
 
 
150 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  33.86 
 
 
151 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35.58 
 
 
149 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  50 
 
 
149 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  32.58 
 
 
128 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  47.92 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  34.86 
 
 
139 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  30.39 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  30.39 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  32.08 
 
 
130 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  48.28 
 
 
153 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  30.39 
 
 
144 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.02 
 
 
120 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  28.68 
 
 
128 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  36.25 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.78 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  27.27 
 
 
170 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  38.98 
 
 
130 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 
134 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  24.63 
 
 
147 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.35 
 
 
151 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  35 
 
 
129 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>