102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13557 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  683    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  45.45 
 
 		 664 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.83 
 
 		 668 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  32.47 
 
 		 1079 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  32.47 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.09 
 
 		 831 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.19 
 
 		 930 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.46 
 
 		 676 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 		 522 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.38 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.94 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.48 
 
 		 579 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  31.15 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  32.58 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.44 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  31.73 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 627 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.46 
 
 		 709 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  28.03 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.14 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30.15 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1750 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.5 
 
 		 930 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.68 
 
 		 752 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.72 
 
 		 2296 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.2 
 
 		 1293 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  30.98 
 
 		 805 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  25.82 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1030 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  29.05 
 
 		 747 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.75 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.19 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.96 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1146 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1163 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.95 
 
 		 963 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1351 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  23.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  27.8 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.32 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  26.85 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1030 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.34 
 
 		 711 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.17 
 
 		 1292 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.17 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  26.51 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  24.62 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  24.88 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.58 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 850 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  28.64 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 892 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1026 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.2 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  33.86 
 
 		 680 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 732 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.9 
 
 		 700 aa  53.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  29.31 
 
 		 211 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1051 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  25.48 
 
 		 950 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  26.42 
 
 		 502 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1763 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.26 
 
 		 1130 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  23.92 
 
 		 260 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.44 
 
 		 1140 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  32.5 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.83 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  25.58 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  23.9 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1834 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.84 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  26.21 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.19 
 
 		 526 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0903  NHL repeat-containing protein  26.77 
 
 		 664 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.772896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  20.74 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1126  NHL repeat containing protein  23.74 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.330169  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  33.96 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 		 770 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.43 
 
 		 693 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  27.83 
 
 		 686 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  27.5 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.68 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.11 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  27.63 
 
 		 1046 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  29.61 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.23 
 
 		 841 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1496  NHL repeat-containing protein  25.21 
 
 		 673 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  24.86 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  27.78 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  37.68 
 
 		 1177 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.38 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 630 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  26.77 
 
 		 642 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>