60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13465 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  78.98 
 
 
176 aa  278  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  69.94 
 
 
173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  54.29 
 
 
180 aa  188  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  34.73 
 
 
194 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  36.21 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  39.74 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  35.63 
 
 
391 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  34.48 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  36.3 
 
 
443 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  33.33 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  34.21 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  35.88 
 
 
1457 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  33.92 
 
 
423 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  27.84 
 
 
760 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  31.71 
 
 
385 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  36 
 
 
645 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  31.52 
 
 
487 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  31.95 
 
 
394 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  31.17 
 
 
408 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  35.33 
 
 
470 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  36.84 
 
 
655 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  31.98 
 
 
391 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  32.68 
 
 
423 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  33.14 
 
 
393 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  32.57 
 
 
975 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  29.46 
 
 
213 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  29.89 
 
 
350 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  32.53 
 
 
580 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  29.89 
 
 
350 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  36.54 
 
 
479 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  33.05 
 
 
382 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  31.01 
 
 
346 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  32.19 
 
 
403 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  32.58 
 
 
448 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  33.52 
 
 
3295 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  27.84 
 
 
445 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  32.46 
 
 
409 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  31.03 
 
 
463 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  30.54 
 
 
391 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  27.98 
 
 
518 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  34.93 
 
 
394 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  31.79 
 
 
463 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  24.26 
 
 
539 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  32.77 
 
 
513 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  33.1 
 
 
413 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  29.59 
 
 
540 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  34.36 
 
 
551 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  29.48 
 
 
582 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  31.72 
 
 
3166 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  32.16 
 
 
1013 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  25.64 
 
 
413 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  36 
 
 
2532 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  36.11 
 
 
391 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  26.79 
 
 
435 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  26.79 
 
 
434 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  30.67 
 
 
525 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  30.67 
 
 
525 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  30.67 
 
 
525 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  26.79 
 
 
556 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>