44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13462 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  56.07 
 
 
173 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  54.29 
 
 
178 aa  188  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  54.34 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  34.1 
 
 
194 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  32.39 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  34.68 
 
 
409 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  34.06 
 
 
391 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  31.46 
 
 
392 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  31.4 
 
 
760 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  34.19 
 
 
406 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  34.1 
 
 
470 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  33.33 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  31.21 
 
 
1457 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  31.13 
 
 
443 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  31.55 
 
 
487 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  31.21 
 
 
350 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  31.21 
 
 
350 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  31.65 
 
 
408 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  32.47 
 
 
380 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  34.9 
 
 
403 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  28.32 
 
 
385 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  31.55 
 
 
655 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  32.14 
 
 
393 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  30.64 
 
 
975 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  28.57 
 
 
409 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  30.23 
 
 
394 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  30 
 
 
391 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  31.07 
 
 
463 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  32.86 
 
 
394 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  31.76 
 
 
580 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  29.94 
 
 
645 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  27.13 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  30.64 
 
 
423 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  32 
 
 
3295 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  30.06 
 
 
582 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  31.87 
 
 
448 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  29.87 
 
 
382 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  30.13 
 
 
346 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  34.06 
 
 
413 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  29.41 
 
 
391 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  33.54 
 
 
551 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  29.82 
 
 
1013 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  32.74 
 
 
479 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>