91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13376 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  55.99 
 
 
2472 aa  947    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  100 
 
 
2532 aa  4690    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  44.34 
 
 
1457 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  54.97 
 
 
3787 aa  939    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  63.68 
 
 
647 aa  597  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  40.62 
 
 
3295 aa  423  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  41.23 
 
 
3166 aa  404  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  46.93 
 
 
975 aa  374  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  46.55 
 
 
760 aa  330  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  45.83 
 
 
1013 aa  318  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  50 
 
 
582 aa  316  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  47.37 
 
 
645 aa  299  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  50.2 
 
 
636 aa  274  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  51.99 
 
 
590 aa  262  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  52.39 
 
 
615 aa  249  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  51.81 
 
 
448 aa  244  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  51.23 
 
 
613 aa  240  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  50.86 
 
 
551 aa  239  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  46.68 
 
 
487 aa  209  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  54.51 
 
 
580 aa  201  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  63.22 
 
 
655 aa  170  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  65.27 
 
 
409 aa  155  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  61.45 
 
 
409 aa  152  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  54.77 
 
 
391 aa  148  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  58.9 
 
 
443 aa  145  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  50 
 
 
406 aa  143  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  57.23 
 
 
423 aa  142  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  62.15 
 
 
391 aa  134  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  52.15 
 
 
396 aa  132  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  55.7 
 
 
380 aa  131  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  56.63 
 
 
470 aa  129  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  49.69 
 
 
392 aa  127  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  51.2 
 
 
385 aa  123  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  52.41 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  52.41 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  45.96 
 
 
391 aa  120  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  56.89 
 
 
423 aa  120  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  55.21 
 
 
408 aa  119  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  52.1 
 
 
403 aa  116  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  60.24 
 
 
463 aa  112  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  57.45 
 
 
479 aa  111  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  56.89 
 
 
394 aa  110  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  58.9 
 
 
393 aa  108  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  50.34 
 
 
382 aa  105  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  51.37 
 
 
394 aa  94.4  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  53.42 
 
 
391 aa  93.6  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  46.67 
 
 
346 aa  92  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  52.82 
 
 
413 aa  89.7  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  38.99 
 
 
518 aa  88.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  32.12 
 
 
194 aa  87.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  33.94 
 
 
539 aa  84.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  47.1 
 
 
316 aa  84.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  47.1 
 
 
316 aa  84.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  46.38 
 
 
315 aa  84  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  34.23 
 
 
556 aa  83.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  51.11 
 
 
285 aa  81.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10359  PPE family protein  36.22 
 
 
183 aa  80.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.215984  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  42.76 
 
 
513 aa  78.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  40 
 
 
435 aa  77.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  38.24 
 
 
540 aa  77  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  40 
 
 
434 aa  77.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  36.52 
 
 
213 aa  76.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  33.13 
 
 
173 aa  72.8  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  39.29 
 
 
368 aa  72.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  37.67 
 
 
463 aa  71.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  38.26 
 
 
536 aa  71.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  47.92 
 
 
551 aa  71.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  34.84 
 
 
178 aa  69.3  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  34.9 
 
 
445 aa  68.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  35.1 
 
 
443 aa  68.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  35.33 
 
 
436 aa  69.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  35.1 
 
 
443 aa  68.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  35.1 
 
 
443 aa  68.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  32.74 
 
 
176 aa  68.6  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  39.33 
 
 
524 aa  65.9  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  41.67 
 
 
278 aa  65.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  41.67 
 
 
278 aa  65.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  39.33 
 
 
525 aa  64.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  39.33 
 
 
525 aa  64.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  39.33 
 
 
525 aa  64.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  34.44 
 
 
439 aa  60.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  37.74 
 
 
496 aa  58.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  48.48 
 
 
77 aa  57.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  27.88 
 
 
180 aa  55.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  53.16 
 
 
185 aa  53.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  26.4 
 
 
591 aa  53.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  37.37 
 
 
413 aa  52.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2900  hypothetical protein  23.03 
 
 
793 aa  48.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.366877  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  30.82 
 
 
452 aa  48.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  30.82 
 
 
452 aa  48.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  41.1 
 
 
265 aa  47.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>