More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13303 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  80.52 
 
 
387 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  100 
 
 
389 aa  799    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  82.55 
 
 
387 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  81.82 
 
 
386 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  90.49 
 
 
388 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  90.23 
 
 
417 aa  729    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  90.49 
 
 
388 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  89.72 
 
 
389 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  90.49 
 
 
388 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  76.58 
 
 
382 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.88 
 
 
387 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.92 
 
 
385 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.97 
 
 
386 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.94 
 
 
384 aa  551  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  70.94 
 
 
385 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.34 
 
 
389 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  67.45 
 
 
387 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.53 
 
 
390 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.53 
 
 
390 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  67.62 
 
 
387 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.12 
 
 
387 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.34 
 
 
391 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.1 
 
 
388 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  65.54 
 
 
389 aa  490  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.45 
 
 
406 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.34 
 
 
387 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.85 
 
 
390 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.59 
 
 
389 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.29 
 
 
404 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.03 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.03 
 
 
380 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  52.65 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  52.65 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  52.65 
 
 
379 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.65 
 
 
379 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  52.65 
 
 
379 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  52.91 
 
 
379 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  52.38 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  52.65 
 
 
379 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  52.38 
 
 
379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  52.38 
 
 
379 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.95 
 
 
381 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.95 
 
 
381 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  47.62 
 
 
379 aa  362  8e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.47 
 
 
379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.35 
 
 
384 aa  355  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
380 aa  350  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  47.87 
 
 
381 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  47.61 
 
 
381 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
376 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
376 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
381 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
376 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
376 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  47.34 
 
 
376 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.23 
 
 
379 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.46 
 
 
379 aa  344  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  47.07 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.94 
 
 
389 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  45.77 
 
 
379 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  45.77 
 
 
379 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  46.42 
 
 
378 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.81 
 
 
376 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.07 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.44 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.49 
 
 
380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.18 
 
 
642 aa  338  8e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.42 
 
 
379 aa  338  9e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.09 
 
 
386 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.55 
 
 
379 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  46.13 
 
 
389 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.05 
 
 
394 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.8 
 
 
389 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  47.09 
 
 
379 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.62 
 
 
379 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.98 
 
 
641 aa  329  7e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.79 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.6 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  47.49 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.62 
 
 
380 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.44 
 
 
382 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  45.21 
 
 
379 aa  326  5e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  46.03 
 
 
379 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.21 
 
 
381 aa  322  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 
379 aa  322  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  45.99 
 
 
386 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.95 
 
 
390 aa  319  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.32 
 
 
379 aa  318  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.12 
 
 
380 aa  317  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3575  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.21 
 
 
380 aa  316  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3306  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.87 
 
 
380 aa  316  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1131  butyryl-CoA dehydrogenase  41.84 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00519609  hitchhiker  0.000110962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.12 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.09 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3307  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.74 
 
 
380 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.5 
 
 
561 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  41.91 
 
 
378 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.33 
 
 
380 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0788  butyryl-CoA dehydrogenase  42.33 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1483  butyryl-CoA dehydrogenase  44.8 
 
 
382 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>