More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13296 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  100 
 
 		 497 aa  992    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  75.69 
 
 		 490 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  75.69 
 
 		 490 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  72.02 
 
 		 493 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  75.9 
 
 		 490 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  71.19 
 
 		 493 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  51.84 
 
 		 676 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.75 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  42.21 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.3 
 
 		 732 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  39.86 
 
 		 538 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.34 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.26 
 
 		 410 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  43.13 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 496 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  38.44 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.93 
 
 		 547 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.3 
 
 		 414 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.23 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.06 
 
 		 382 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.17 
 
 		 664 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1299  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 340 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.63 
 
 		 497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.45 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.74 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  41.07 
 
 		 307 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.43 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.64 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.45 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.45 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.13 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.74 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.24 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.92 
 
 		 306 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 486 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.54 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.29 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.79 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.36 
 
 		 618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.63 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.15 
 
 		 466 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.29 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.9 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.6 
 
 		 393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.37 
 
 		 307 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.5 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.45 
 
 		 516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.58 
 
 		 463 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.55 
 
 		 545 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  28.38 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.79 
 
 		 625 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.25 
 
 		 520 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  31.8 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09620  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.4 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.369888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.98 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.73 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.18 
 
 		 549 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.79 
 
 		 404 aa  127  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.94 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.97 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  27.99 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.03 
 
 		 400 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.06 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.27 
 
 		 424 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  32.14 
 
 		 684 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  33.69 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.48 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.27 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.88 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.41 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.54 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.56 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.03 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  27.3 
 
 		 734 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.94 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3559  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.28 
 
 		 352 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  31.21 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.56 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.63 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.5 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  29.78 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.04 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.38 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.18 
 
 		 560 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4011  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.01 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  31.82 
 
 		 373 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  29.08 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.18 
 
 		 313 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.77 
 
 		 649 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.37 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.12 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.87 
 
 		 312 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.83 
 
 		 395 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.7 
 
 		 619 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.71 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>