More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13153 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  100 
 
 		 578 aa  1139    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63 
 
 		 566 aa  668    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  65.06 
 
 		 568 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63 
 
 		 566 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  65.06 
 
 		 568 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  65.12 
 
 		 559 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63 
 
 		 566 aa  668    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  64.88 
 
 		 568 aa  668    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63.79 
 
 		 575 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  62.5 
 
 		 573 aa  626  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 		 595 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  44.09 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 		 567 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 571 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  44.13 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 573 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  42.18 
 
 		 591 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.98 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 580 aa  359  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 592 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 565 aa  335  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 568 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 588 aa  329  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 543 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  39.54 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  37.98 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  39.36 
 
 		 536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  37.3 
 
 		 543 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 571 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 631 aa  256  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 590 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 535 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  33.67 
 
 		 635 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  53.01 
 
 		 392 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 550 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 381 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  33.63 
 
 		 851 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.94 
 
 		 828 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  33.5 
 
 		 391 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 409 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  31.32 
 
 		 385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  33.58 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.92 
 
 		 373 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  33.44 
 
 		 673 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 725 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  33.18 
 
 		 484 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.23 
 
 		 547 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  25.46 
 
 		 516 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  24.67 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  24.45 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  35.25 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  29.12 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 396 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  28.74 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 523 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 345 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 682 aa  87.8  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 464 aa  87  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  25.21 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  24.56 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  23.14 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  24.56 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  24.56 
 
 		 365 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.29 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  23.69 
 
 		 372 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  24.56 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  24.56 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  27.89 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.27 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  30.73 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  27.82 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>