More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13097 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  100 
 
 
1110 aa  2207    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.41 
 
 
914 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.91 
 
 
901 aa  493  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
921 aa  396  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  58.15 
 
 
1009 aa  340  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  58.15 
 
 
1009 aa  340  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  60.92 
 
 
1017 aa  340  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  58.57 
 
 
993 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.95 
 
 
913 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  29.5 
 
 
900 aa  245  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.69 
 
 
867 aa  237  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.72 
 
 
876 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.33 
 
 
947 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.5 
 
 
1021 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.48 
 
 
877 aa  218  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.74 
 
 
870 aa  217  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.98 
 
 
897 aa  211  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  34.95 
 
 
917 aa  211  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.42 
 
 
878 aa  211  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  29.16 
 
 
887 aa  208  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.88 
 
 
1003 aa  207  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  34.32 
 
 
906 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
914 aa  204  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  33.41 
 
 
914 aa  204  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.13 
 
 
924 aa  203  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  33.4 
 
 
906 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  44.77 
 
 
558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  29.39 
 
 
903 aa  198  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  29.39 
 
 
903 aa  198  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.96 
 
 
930 aa  194  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.12 
 
 
905 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.89 
 
 
905 aa  191  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.05 
 
 
894 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.83 
 
 
913 aa  188  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  33.41 
 
 
905 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.03 
 
 
904 aa  187  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 
921 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  29.04 
 
 
960 aa  186  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 
921 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 
921 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  33.18 
 
 
905 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  31.12 
 
 
901 aa  185  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.8 
 
 
922 aa  184  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
904 aa  184  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.08 
 
 
932 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  32 
 
 
914 aa  182  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  30.21 
 
 
902 aa  181  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.52 
 
 
880 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.54 
 
 
911 aa  180  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.48 
 
 
947 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  29.42 
 
 
907 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 
910 aa  179  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  32.48 
 
 
920 aa  179  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 
519 aa  179  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
947 aa  178  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6706  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
664 aa  178  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0848687  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.61 
 
 
905 aa  178  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  28.47 
 
 
902 aa  177  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.79 
 
 
900 aa  177  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.6 
 
 
930 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  30.52 
 
 
913 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.74 
 
 
766 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  29.57 
 
 
907 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  29.16 
 
 
901 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  29.16 
 
 
901 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  29.16 
 
 
902 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  29.16 
 
 
901 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  27.08 
 
 
896 aa  174  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  28.94 
 
 
901 aa  174  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  29.67 
 
 
901 aa  172  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  29.67 
 
 
901 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1757  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
510 aa  172  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.67 
 
 
901 aa  172  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  29.67 
 
 
901 aa  171  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  29.67 
 
 
901 aa  172  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  29.65 
 
 
907 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  29.67 
 
 
901 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2199  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 
522 aa  170  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0725678  hitchhiker  0.00985459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  29.47 
 
 
901 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  29.47 
 
 
901 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.14 
 
 
1019 aa  168  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05610  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
693 aa  166  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.850356  normal  0.365615 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.66 
 
 
901 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.94 
 
 
863 aa  165  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.78 
 
 
921 aa  163  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
605 aa  162  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  35.14 
 
 
900 aa  162  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  39.44 
 
 
695 aa  161  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  29.32 
 
 
899 aa  161  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4344  protein kinase  32.76 
 
 
504 aa  160  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
591 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4785  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
395 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  30.98 
 
 
904 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  27.19 
 
 
1336 aa  159  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 
776 aa  159  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  27.21 
 
 
919 aa  158  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.28 
 
 
896 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 
411 aa  158  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
632 aa  157  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.29 
 
 
596 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>