223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13060 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  100 
 
 
359 aa  718    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  62.32 
 
 
380 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  61.05 
 
 
353 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  61.05 
 
 
353 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  60.77 
 
 
353 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  61.86 
 
 
405 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
310 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  33.1 
 
 
309 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  33.55 
 
 
346 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.48 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
662 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  32.47 
 
 
300 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.11 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  24.17 
 
 
316 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
324 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3282  periplasmic binding protein  30 
 
 
329 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.26 
 
 
321 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.26 
 
 
321 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.26 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.26 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.76 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.09 
 
 
321 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.26 
 
 
321 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  28.04 
 
 
320 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  27.68 
 
 
320 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.68 
 
 
320 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  31.6 
 
 
298 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.38 
 
 
326 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  27.68 
 
 
321 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2943  periplasmic binding protein  28.44 
 
 
305 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.382264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  27.31 
 
 
320 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.09 
 
 
322 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  27.31 
 
 
320 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.09 
 
 
322 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  27.31 
 
 
320 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  25.45 
 
 
322 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  27.31 
 
 
320 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  27.11 
 
 
305 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28.36 
 
 
306 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
331 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.42 
 
 
336 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.74 
 
 
320 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  32.23 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  27.57 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  29.03 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  26.21 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.51 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  26.95 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.07 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.18 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.18 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.18 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.18 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  29.75 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  24.2 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  24.2 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  25.91 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.2 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.2 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.95 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  29.84 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.88 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.95 
 
 
312 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  22.95 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.71 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.85 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  27.05 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  23.7 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  26.35 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  25.63 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.37 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  24.18 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  26.74 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.52 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.12 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.38 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.38 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.38 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.35 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  25.19 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  21.71 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2421  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  29.61 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.3 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.3 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.3 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  26.17 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>