More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12954 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.23 
 
 		 1867 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 		 3080 aa  885    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.56 
 
 		 3101 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  35.46 
 
 		 1602 aa  690    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  45.91 
 
 		 1822 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.78 
 
 		 1804 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.08 
 
 		 2719 aa  986    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.92 
 
 		 2890 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  43.13 
 
 		 2220 aa  1494    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.14 
 
 		 3930 aa  778    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 1874 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.9 
 
 		 3158 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 7110 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.42 
 
 		 1966 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  33.84 
 
 		 3449 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.01 
 
 		 2604 aa  863    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  47.43 
 
 		 1076 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.95 
 
 		 1939 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.54 
 
 		 3111 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  38.42 
 
 		 2188 aa  1193    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.17 
 
 		 2136 aa  688    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  62.84 
 
 		 2101 aa  2494    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  33.89 
 
 		 3176 aa  927    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 		 3693 aa  935    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  65.94 
 
 		 2108 aa  2649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  41.95 
 
 		 1520 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 		 1190 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  63.02 
 
 		 2085 aa  2568    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 		 1704 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.45 
 
 		 4183 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.34 
 
 		 2230 aa  1120    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.03 
 
 		 1832 aa  690    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  39.61 
 
 		 3508 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  42.98 
 
 		 2162 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  38.77 
 
 		 3494 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  28.95 
 
 		 2134 aa  709    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  100 
 
 		 2111 aa  4257    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  39.06 
 
 		 1806 aa  803    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.18 
 
 		 3693 aa  935    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  41.95 
 
 		 1520 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 		 1190 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  63.02 
 
 		 2085 aa  2568    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 		 1704 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34 
 
 		 3676 aa  922    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  33.61 
 
 		 3696 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  44.36 
 
 		 1537 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 		 1805 aa  828    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  45.49 
 
 		 1812 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 		 2232 aa  1217    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  42.08 
 
 		 1263 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.68 
 
 		 1822 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  39.05 
 
 		 1827 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  43.45 
 
 		 2111 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.26 
 
 		 3702 aa  934    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.57 
 
 		 2333 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  45.73 
 
 		 1190 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  63.02 
 
 		 2085 aa  2566    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  43.14 
 
 		 1704 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  64.12 
 
 		 2126 aa  2606    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  35.71 
 
 		 2225 aa  1085    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 3679 aa  887    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.09 
 
 		 2126 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  34.6 
 
 		 1835 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  42.08 
 
 		 1698 aa  635  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  38.93 
 
 		 2108 aa  633  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  39.11 
 
 		 7210 aa  632  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  37.49 
 
 		 7279 aa  633  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  38.91 
 
 		 5255 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  39.2 
 
 		 1789 aa  629  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.4 
 
 		 2462 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  39.27 
 
 		 3408 aa  629  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 		 1580 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 		 1580 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  34.75 
 
 		 1876 aa  625  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  37.55 
 
 		 2020 aa  626  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  42.96 
 
 		 4607 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 		 1831 aa  623  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  36.53 
 
 		 2090 aa  621  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  37.87 
 
 		 1823 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  41.4 
 
 		 1744 aa  619  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  44.54 
 
 		 1580 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  36.75 
 
 		 2277 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  38.94 
 
 		 4151 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.57 
 
 		 2966 aa  615  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.52 
 
 		 3424 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38.15 
 
 		 1828 aa  617  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.39 
 
 		 2551 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  38.51 
 
 		 1144 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  39.32 
 
 		 4080 aa  606  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  38.91 
 
 		 4930 aa  602  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  42.04 
 
 		 1114 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 		 1656 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  38.73 
 
 		 6768 aa  602  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  40.14 
 
 		 1819 aa  600  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  39.26 
 
 		 3355 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.04 
 
 		 1305 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  42.68 
 
 		 1584 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  36.89 
 
 		 1820 aa  593  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.87 
 
 		 1587 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  33.94 
 
 		 1349 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>