More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12947 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  34.57 
 
 
2333 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.28 
 
 
2136 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  30.73 
 
 
2134 aa  827    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  32.68 
 
 
3080 aa  895    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  37.59 
 
 
2126 aa  1154    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  38.43 
 
 
2111 aa  1186    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  37.04 
 
 
2108 aa  1127    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  100 
 
 
2188 aa  4380    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  36.23 
 
 
3449 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.81 
 
 
1832 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.13 
 
 
1874 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  32.9 
 
 
4151 aa  816    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  34.03 
 
 
4607 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  39.72 
 
 
2220 aa  1280    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
7110 aa  652    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.21 
 
 
4183 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  65.47 
 
 
1537 aa  1124    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.49 
 
 
1939 aa  673    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  36.27 
 
 
2225 aa  1134    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  31.78 
 
 
2060 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.95 
 
 
2232 aa  1241    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.97 
 
 
3176 aa  1014    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  37.38 
 
 
2890 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 
3693 aa  983    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  53.48 
 
 
1577 aa  862    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  64.03 
 
 
1520 aa  1186    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  64.45 
 
 
1190 aa  1175    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  56.2 
 
 
1580 aa  869    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  37.77 
 
 
2085 aa  1143    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  32.46 
 
 
3930 aa  783    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.61 
 
 
2230 aa  735    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  47.46 
 
 
1827 aa  1124    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 
2367 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  34.06 
 
 
2604 aa  865    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  38.33 
 
 
2162 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  61.51 
 
 
1876 aa  1037    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 
3693 aa  983    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  63.21 
 
 
1822 aa  1167    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  64.03 
 
 
1520 aa  1186    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  64.45 
 
 
1190 aa  1175    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  56.2 
 
 
1580 aa  869    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  37.77 
 
 
2085 aa  1143    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 
3676 aa  988    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.9 
 
 
1822 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 
3696 aa  959    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.88 
 
 
1909 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  45.61 
 
 
1805 aa  1097    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  66.93 
 
 
1812 aa  1199    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  53.91 
 
 
1581 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  53.58 
 
 
1828 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  37.53 
 
 
2101 aa  1123    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  43.18 
 
 
1823 aa  919    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.99 
 
 
1867 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 
3679 aa  949    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 
3702 aa  985    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  45.88 
 
 
1806 aa  1073    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  64.56 
 
 
1190 aa  1175    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  56.09 
 
 
1580 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  37.82 
 
 
2085 aa  1148    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43.57 
 
 
1587 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.57 
 
 
3111 aa  635  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.73 
 
 
1804 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  36.89 
 
 
7279 aa  628  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  35.85 
 
 
3508 aa  629  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  35.73 
 
 
3408 aa  625  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  41.87 
 
 
2111 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  36.78 
 
 
2126 aa  627  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  34.79 
 
 
3101 aa  620  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  35.95 
 
 
1789 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  36.08 
 
 
2108 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.92 
 
 
1656 aa  615  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 
7210 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.65 
 
 
2966 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  37.98 
 
 
2846 aa  612  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  36.39 
 
 
2719 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  36.59 
 
 
3355 aa  608  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  39.52 
 
 
1704 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.59 
 
 
2090 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  39.52 
 
 
1704 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  40.86 
 
 
1263 aa  603  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  35.77 
 
 
2277 aa  602  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  37.87 
 
 
3670 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  37.67 
 
 
5255 aa  599  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  38.18 
 
 
1835 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  42.59 
 
 
3424 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
5154 aa  596  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  41.35 
 
 
1601 aa  596  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  36.41 
 
 
4111 aa  595  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  33.88 
 
 
3494 aa  596  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.28 
 
 
1305 aa  597  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  38.54 
 
 
1744 aa  596  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 
1704 aa  596  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  35.66 
 
 
1698 aa  592  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.21 
 
 
1144 aa  593  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.87 
 
 
4478 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  42.18 
 
 
1076 aa  588  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  38.14 
 
 
6768 aa  590  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 
3645 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  39.42 
 
 
4575 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
3874 aa  587  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>