More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12945 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  40.95 
 
 
2220 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  38.07 
 
 
2126 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.63 
 
 
1832 aa  781    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.89 
 
 
2890 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  46.12 
 
 
2111 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  100 
 
 
1876 aa  3780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.67 
 
 
2136 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  40.99 
 
 
1263 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.92 
 
 
1939 aa  848    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  59.81 
 
 
1577 aa  1172    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  51.61 
 
 
1806 aa  912    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  36.84 
 
 
1698 aa  900    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
1874 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 
1656 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  38.94 
 
 
1832 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  55.48 
 
 
1823 aa  1918    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 
1704 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  44.42 
 
 
1819 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  70.39 
 
 
1537 aa  1222    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.76 
 
 
7279 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
7110 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  56.29 
 
 
1520 aa  940    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  56.05 
 
 
1190 aa  921    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  63.47 
 
 
1580 aa  1222    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  35.6 
 
 
2085 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
1704 aa  946    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.56 
 
 
2232 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  33.2 
 
 
5255 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  55.01 
 
 
1822 aa  896    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  41.69 
 
 
1402 aa  694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  62.79 
 
 
2188 aa  1034    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  36.46 
 
 
1835 aa  951    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  48.01 
 
 
2162 aa  854    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  56.29 
 
 
1520 aa  940    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  56.05 
 
 
1190 aa  921    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  63.47 
 
 
1580 aa  1222    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  35.6 
 
 
2085 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
1704 aa  946    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.53 
 
 
2333 aa  683    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  50.49 
 
 
1805 aa  919    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  56.41 
 
 
1812 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  63.23 
 
 
1581 aa  1181    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  57.76 
 
 
1828 aa  2031    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  36.23 
 
 
1744 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 
2230 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.94 
 
 
1909 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.67 
 
 
1822 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  32.7 
 
 
3449 aa  739    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  56.27 
 
 
1190 aa  921    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  63.47 
 
 
1580 aa  1206    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  35.52 
 
 
2085 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  37.2 
 
 
1704 aa  940    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  32.21 
 
 
2846 aa  635  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  40.02 
 
 
2126 aa  632  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.74 
 
 
3930 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  32.61 
 
 
2277 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.04 
 
 
2719 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
5400 aa  626  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  33.49 
 
 
2090 aa  625  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.46 
 
 
3679 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  38.99 
 
 
2966 aa  623  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  34.27 
 
 
2111 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.62 
 
 
2108 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  42.45 
 
 
1076 aa  615  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  33.96 
 
 
4183 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.16 
 
 
3693 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  34.59 
 
 
3408 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.16 
 
 
3693 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
3676 aa  612  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.95 
 
 
3696 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.16 
 
 
3702 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  39.06 
 
 
2101 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.74 
 
 
3494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  38.92 
 
 
6768 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.08 
 
 
2225 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  35.35 
 
 
3670 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  28.77 
 
 
2462 aa  600  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  38.81 
 
 
3424 aa  599  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  36.85 
 
 
4151 aa  598  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.15 
 
 
1144 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 
1587 aa  591  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  40.63 
 
 
2719 aa  593  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  36.73 
 
 
2020 aa  588  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.16 
 
 
3493 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
5154 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  34.68 
 
 
4111 aa  586  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 
2880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  37.29 
 
 
1966 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  40 
 
 
3427 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 
7210 aa  582  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  38.25 
 
 
4575 aa  583  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.19 
 
 
1789 aa  583  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  37.45 
 
 
2762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  41.07 
 
 
2053 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  36.82 
 
 
2108 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.24 
 
 
1087 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  37.95 
 
 
4607 aa  579  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.18 
 
 
3176 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.64 
 
 
1804 aa  579  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  35.58 
 
 
3508 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>