More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12944 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  55.73 
 
 
584 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  61.66 
 
 
592 aa  733    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  56.19 
 
 
576 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  55.65 
 
 
577 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  60.38 
 
 
580 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  62.16 
 
 
592 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  63.17 
 
 
619 aa  742    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  56.38 
 
 
601 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
626 aa  1276    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  56.28 
 
 
578 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  61.31 
 
 
580 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  56.38 
 
 
601 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  56.38 
 
 
601 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  60.97 
 
 
580 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  57.53 
 
 
583 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  58.35 
 
 
584 aa  649    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  60.51 
 
 
631 aa  708    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
573 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  52.51 
 
 
573 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  50.95 
 
 
590 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  50.95 
 
 
590 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  51.12 
 
 
590 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  44.06 
 
 
585 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 
597 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  41.96 
 
 
574 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  41.7 
 
 
593 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 
640 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  39.55 
 
 
1067 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.98 
 
 
629 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
636 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.1 
 
 
637 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  41.7 
 
 
593 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.8 
 
 
629 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  39.86 
 
 
620 aa  363  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 
629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 
629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 
629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 
1656 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  38.5 
 
 
2997 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  38.55 
 
 
607 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  39.9 
 
 
605 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  39.9 
 
 
605 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  39.9 
 
 
605 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
579 aa  340  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
582 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.38 
 
 
2762 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 
611 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
725 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 
725 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  39.07 
 
 
4318 aa  319  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
592 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
608 aa  319  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
597 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
597 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.82 
 
 
4332 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.69 
 
 
4317 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.01 
 
 
4317 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  33.45 
 
 
581 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.83 
 
 
4336 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.21 
 
 
4317 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.21 
 
 
4317 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
991 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.93 
 
 
581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.68 
 
 
1801 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.57 
 
 
2250 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 
2103 aa  307  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.59 
 
 
4336 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.08 
 
 
3231 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  36.82 
 
 
2721 aa  302  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
706 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
602 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
593 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.51 
 
 
1474 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  35.22 
 
 
755 aa  300  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.38 
 
 
2791 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  32.94 
 
 
588 aa  299  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.21 
 
 
3235 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.76 
 
 
6403 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  31.8 
 
 
559 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.56 
 
 
4342 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  31.69 
 
 
564 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
609 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.26 
 
 
1699 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.14 
 
 
4342 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  34.77 
 
 
610 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.77 
 
 
599 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.55 
 
 
3208 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
610 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.69 
 
 
599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.69 
 
 
599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.84 
 
 
2820 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.69 
 
 
610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.1 
 
 
1753 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  36.57 
 
 
6272 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>