183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12929 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  75.62 
 
 
368 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  75.62 
 
 
368 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  75.07 
 
 
360 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  75.34 
 
 
368 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  73.11 
 
 
362 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  65.16 
 
 
356 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  61.89 
 
 
354 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  59.89 
 
 
364 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  59.33 
 
 
361 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  56.61 
 
 
366 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  54.39 
 
 
378 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  55.62 
 
 
359 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  52.54 
 
 
361 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  56.58 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  51.83 
 
 
362 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  53.45 
 
 
360 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  53.78 
 
 
360 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  56.5 
 
 
359 aa  326  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  53.19 
 
 
373 aa  325  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  53.14 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  52.39 
 
 
359 aa  319  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  50.98 
 
 
359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  51.69 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  50.45 
 
 
358 aa  300  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  49.31 
 
 
367 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.32 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  48.21 
 
 
358 aa  272  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.81 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  37.06 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.45 
 
 
423 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  30.15 
 
 
390 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.18 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.91 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.76 
 
 
426 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.91 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.91 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.76 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.2 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.44 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.44 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.44 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  34.01 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.57 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  35.04 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.88 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.45 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  32.99 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.43 
 
 
407 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.28 
 
 
424 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.6 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.49 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.81 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.83 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.33 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  27.6 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.55 
 
 
459 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  35.78 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.49 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.54 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.67 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.06 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.88 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  29.81 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  29.19 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.12 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  27.6 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.68 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.11 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.58 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  28.18 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.86 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  26.1 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  29.62 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  25.94 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  29.02 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  26.84 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.37 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  26.52 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.72 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.51 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  27.98 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.64 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  27.59 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.65 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  24.31 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.67 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.94 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  24.51 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  31.98 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.9 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  26.06 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.75 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.64 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.37 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.14 
 
 
432 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.58 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  26.83 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  26.9 
 
 
480 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>