More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12898 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12898  transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.385025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4525  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4908  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4612  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6823  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1650  response regulator receiver protein  50.68 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5097  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0337  winged helix family two component response transcriptional regulator  48.89 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0293  winged helix family two component response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3935  transcriptional regulator domain protein  48.72 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3545  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10833  transcriptional regulatory protein  47.2 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6372  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4983  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0595  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0443  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6176  winged helix family two component response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37670  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.43 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0528352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2025  response regulator receiver protein  51.89 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3419  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4376  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2737  transcriptional regulatory protein  46.22 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0453  putative winged helix family two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.275136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4646  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  46.57 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4240  transcriptional regulator domain-containing protein  43.06 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0895  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.56 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.793732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0439  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.190602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8253  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3012  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.721979  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0189  transcriptional regulatory protein, C-terminal domain protein  39.57 
 
 		 296 aa  162  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3035  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1194  putative response regulator  39.15 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0879  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249855  hitchhiker  0.00478466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2724  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00387379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3090  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  41.43 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19870  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.89 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03550  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.76 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6843  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  42.05 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1162  transcriptional regulator, putative  36.05 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.829609  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0241  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08240  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  36.62 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  0.778898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.28 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2015  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0839248  hitchhiker  0.0000000000000188648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  39.39 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  32.16 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.16 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  31.08 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  35.42 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  30.21 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3253  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_944  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  30.41 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  31.86 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  30.65 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 223 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 223 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.69 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  38.69 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  31.28 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  31.28 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1126  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000289398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  28.92 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>