154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12758 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  69.03 
 
 		 110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  57.14 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  65.85 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  55.96 
 
 		 179 aa  96.7  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  59.14 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  63.16 
 
 		 101 aa  95.9  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  65.43 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  65.75 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  72.06 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  54.46 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.14 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  64.2 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  64.47 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  64.2 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  65.67 
 
 		 245 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  60.53 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  61.84 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  53.19 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  61.64 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  60 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  58.97 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  66.15 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  51.72 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  50.47 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  63.29 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  61.54 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  57.83 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  64.91 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  51.22 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  52.24 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  60.38 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  54.84 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 325 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 277 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  64.1 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 500 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  42.59 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 496 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 505 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  38.75 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  33.82 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  34.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  34.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  34.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  34.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>