41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12735 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1382    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  48.75 
 
 		 686 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  46.04 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  59.71 
 
 		 754 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  59.71 
 
 		 705 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  59.47 
 
 		 706 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  29.21 
 
 		 1040 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  33.61 
 
 		 928 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  29.52 
 
 		 967 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  30.39 
 
 		 695 aa  105  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  30.83 
 
 		 654 aa  90.5  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  29.09 
 
 		 780 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.58 
 
 		 879 aa  81.6  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  27.45 
 
 		 664 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  28.16 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  31.88 
 
 		 306 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  30.35 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  28 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.07 
 
 		 846 aa  74.3  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  25.22 
 
 		 867 aa  70.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  33.85 
 
 		 407 aa  70.5  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  28.38 
 
 		 595 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  27.38 
 
 		 396 aa  67  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 892 aa  66.6  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  34.84 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  26.54 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  26.79 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  35.92 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  36.94 
 
 		 541 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  36.04 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  41.51 
 
 		 233 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  30.22 
 
 		 300 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  33.33 
 
 		 537 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  32.5 
 
 		 205 aa  51.2  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  33.54 
 
 		 312 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  27.52 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  46.51 
 
 		 191 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>