More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12675 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  100 
 
 
375 aa  766  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.14455e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  58.47 
 
 
385 aa  405  1e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  57.18 
 
 
368 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  54.92 
 
 
388 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  60.64 
 
 
379 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  42.56 
 
 
387 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  40.91 
 
 
373 aa  252  9e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  35.52 
 
 
395 aa  190  3e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  34.24 
 
 
394 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  31.31 
 
 
427 aa  164  2e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  33.44 
 
 
323 aa  140  4e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  38.55 
 
 
451 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  28.9 
 
 
407 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  30.85 
 
 
407 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.39 
 
 
390 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.56 
 
 
365 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.49 
 
 
368 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  28.06 
 
 
302 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  29.79 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.75 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  25.14 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.6 
 
 
357 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.4 
 
 
260 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.98 
 
 
297 aa  92.8  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  26.98 
 
 
297 aa  92.8  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.83 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.3 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.93 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.7 
 
 
477 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.16 
 
 
325 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.17 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.54 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.89 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  25.36 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.35 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  22.19 
 
 
374 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.33 
 
 
378 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  27.01 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.74 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  28.62 
 
 
390 aa  85.1  2e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.21 
 
 
357 aa  84.3  3e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.21 
 
 
370 aa  84.3  3e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.89 
 
 
416 aa  84  4e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  29.55 
 
 
404 aa  84  4e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.9 
 
 
383 aa  83.6  5e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.77 
 
 
380 aa  81.3  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 
374 aa  81.6  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25 
 
 
374 aa  81.6  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  25.07 
 
 
357 aa  81.3  3e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.86 
 
 
370 aa  80.5  4e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.81 
 
 
370 aa  80.1  5e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  27.42 
 
 
293 aa  80.1  6e-14  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.1 
 
 
373 aa  79.7  7e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.85 
 
 
398 aa  79.3  1e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  26.84 
 
 
451 aa  78.6  2e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.55 
 
 
378 aa  78.2  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.6 
 
 
396 aa  78.6  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  25.27 
 
 
391 aa  78.2  2e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.37 
 
 
378 aa  77.4  4e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.98 
 
 
368 aa  77.4  4e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.74 
 
 
369 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24 
 
 
393 aa  75.5  1e-12  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.6 
 
 
402 aa  74.7  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  23.6 
 
 
401 aa  75.5  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.09 
 
 
369 aa  75.1  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.36 
 
 
376 aa  74.3  3e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.36 
 
 
376 aa  74.3  3e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  26.47 
 
 
398 aa  74.3  3e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.71 
 
 
376 aa  74.3  3e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  24.44 
 
 
399 aa  73.6  5e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  26.67 
 
 
498 aa  73.6  6e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  22.8 
 
 
386 aa  73.6  6e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.05 
 
 
388 aa  73.2  7e-12  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  23.78 
 
 
361 aa  72.8  9e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.59 
 
 
369 aa  72.4  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  27.75 
 
 
374 aa  72.4  1e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.29 
 
 
383 aa  71.6  2e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.75 
 
 
387 aa  71.6  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  24 
 
 
371 aa  71.6  2e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.72 
 
 
381 aa  72  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.74 
 
 
337 aa  71.6  2e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  35.85 
 
 
334 aa  70.9  3e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.53 
 
 
376 aa  70.9  3e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  22.45 
 
 
400 aa  71.2  3e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  25.14 
 
 
433 aa  70.9  4e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.1 
 
 
373 aa  70.9  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.88 
 
 
385 aa  70.5  5e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.18 
 
 
388 aa  70.1  5e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  24.09 
 
 
292 aa  70.5  5e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  4.02051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.44 
 
 
385 aa  70.1  6e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.99 
 
 
276 aa  69.7  8e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.42 
 
 
454 aa  69.7  8e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.41 
 
 
381 aa  68.9  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  25.66 
 
 
503 aa  69.3  1e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.22 
 
 
431 aa  68.2  2e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.96 
 
 
391 aa  68.2  2e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.83 
 
 
363 aa  67.8  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  22.22 
 
 
409 aa  67  4e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.55 
 
 
376 aa  67  5e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.87 
 
 
424 aa  67  5e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>