53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12667 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  100 
 
 
177 aa  347  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  32.08 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  36.6 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  35.76 
 
 
371 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  27.78 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  29.37 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  33.77 
 
 
248 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  31.97 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  31.97 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  31.97 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  31.97 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  32.17 
 
 
222 aa  60.8  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  32.17 
 
 
222 aa  60.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  34.31 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  31.48 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  32.08 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  37.39 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  31.45 
 
 
240 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  30.2 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  30.43 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  33.78 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  28.49 
 
 
201 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  29.01 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  29.01 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  29.12 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  37.69 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  31.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  31.76 
 
 
198 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  29.17 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  33.58 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  28.22 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  27.08 
 
 
562 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  31.72 
 
 
240 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  31.65 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  33.33 
 
 
231 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  28.77 
 
 
514 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  32.52 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  30.28 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  29.86 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  29.95 
 
 
233 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  29.86 
 
 
220 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  33.54 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  34.85 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  29.09 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  29.58 
 
 
177 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  34.85 
 
 
156 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  30.56 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  34.85 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  29.25 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  32.03 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  28.03 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  31.2 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  29.65 
 
 
243 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>