More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12658 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  76.47 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  72.03 
 
 		 119 aa  173  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  69.49 
 
 		 135 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  55.83 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  55 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  78.31 
 
 		 105 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  61.34 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.64 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.18 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  48.19 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.2 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  43.27 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  46.43 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  44.79 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  39.25 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  32.38 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  43.9 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  45.33 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  46.38 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  39.24 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 337 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  42.03 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4187  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  35.16 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>