48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12638 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  58.49 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  58.33 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  54.63 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  56.36 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  56.36 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  56.36 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  55.05 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  50.46 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  49.53 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.29 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  52.78 
 
 		 277 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  51.4 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.21 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  53.7 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  43.64 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  46.79 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  49.04 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  50.93 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  36.61 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  36.62 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  31.25 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  32.39 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  32.88 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  32.86 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  26.21 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 111 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 115 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>