152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12627 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  100 
 
 
580 aa  1137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.2358e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  54.58 
 
 
528 aa  283  6e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  45.86 
 
 
655 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  59.7 
 
 
760 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  43.25 
 
 
588 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  56.38 
 
 
3295 aa  213  5e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  49.52 
 
 
975 aa  212  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  1.53091e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  44.16 
 
 
468 aa  211  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  54.15 
 
 
448 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  47.32 
 
 
582 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  7.13233e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  50.54 
 
 
1457 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  41.61 
 
 
533 aa  203  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  52.25 
 
 
3166 aa  191  3e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  41.12 
 
 
502 aa  191  3e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  47.26 
 
 
487 aa  186  1e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  43.56 
 
 
645 aa  178  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  52.88 
 
 
551 aa  176  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.28496e-05  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  56.83 
 
 
590 aa  176  1e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  54.47 
 
 
3787 aa  176  1e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  66.67 
 
 
409 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  49.32 
 
 
2532 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  56.36 
 
 
636 aa  163  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  59.16 
 
 
391 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  55.29 
 
 
409 aa  157  5e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  48.61 
 
 
1013 aa  155  3e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  53.53 
 
 
423 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  54.3 
 
 
443 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.54935e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  36.87 
 
 
526 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  56.65 
 
 
403 aa  144  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  48.82 
 
 
396 aa  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  55.19 
 
 
380 aa  142  1e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  34.64 
 
 
540 aa  142  2e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  62.13 
 
 
391 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  47.65 
 
 
392 aa  140  9e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  53.57 
 
 
470 aa  140  9e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  53.57 
 
 
385 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  55.36 
 
 
408 aa  136  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  54.55 
 
 
350 aa  135  1e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  54.55 
 
 
350 aa  136  1e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  35.38 
 
 
517 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  44.95 
 
 
406 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  8.59509e-09 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  34.69 
 
 
517 aa  131  4e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  34.69 
 
 
517 aa  131  4e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  42.5 
 
 
615 aa  129  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.05692e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  55.19 
 
 
382 aa  129  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  49.41 
 
 
391 aa  129  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  57.42 
 
 
423 aa  129  2e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  58.94 
 
 
393 aa  127  8e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  46.08 
 
 
647 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  56.55 
 
 
463 aa  122  2e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1557e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  37.25 
 
 
499 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  35.12 
 
 
517 aa  119  1e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  48.43 
 
 
613 aa  117  7e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.6115e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  35.52 
 
 
533 aa  115  2e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  55.36 
 
 
394 aa  115  2e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  56.65 
 
 
479 aa  112  1e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  5.42589e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  55.63 
 
 
394 aa  112  1e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  110  7e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  56.95 
 
 
391 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  53.76 
 
 
413 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  32.5 
 
 
494 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  32.52 
 
 
307 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  32.52 
 
 
307 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  32.52 
 
 
307 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  36.09 
 
 
194 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  41.57 
 
 
341 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  41.57 
 
 
341 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  32 
 
 
413 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  32 
 
 
433 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  32 
 
 
433 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  28.26 
 
 
527 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  28.26 
 
 
529 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  28.26 
 
 
529 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  28.25 
 
 
518 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  33.06 
 
 
391 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  31.86 
 
 
423 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  32.9 
 
 
539 aa  85.1  3e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.93928e-11  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  41.94 
 
 
346 aa  85.1  3e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  31.76 
 
 
458 aa  85.1  3e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  38.85 
 
 
436 aa  85.1  3e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  40.34 
 
 
213 aa  81.6  3e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  29.97 
 
 
542 aa  81.3  5e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  29.97 
 
 
542 aa  81.3  5e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  29.97 
 
 
542 aa  81.3  5e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  35.06 
 
 
445 aa  80.5  7e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  32.34 
 
 
411 aa  79  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  34.89 
 
 
433 aa  78.6  3e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
469 aa  78.6  3e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  32.53 
 
 
178 aa  78.2  3e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.13323e-10  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  32.89 
 
 
556 aa  77.8  6e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  31.98 
 
 
401 aa  77.4  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  36.54 
 
 
443 aa  77  9e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  36.54 
 
 
443 aa  77  9e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  41.46 
 
 
368 aa  77  9e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  32.53 
 
 
173 aa  76.6  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  36.54 
 
 
443 aa  77  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  33.96 
 
 
518 aa  75.9  2e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  31.76 
 
 
180 aa  75.5  2e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.19714e-09  decreased coverage  4.0288e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  37.34 
 
 
540 aa  74.7  4e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  29.58 
 
 
783 aa  73.6  9e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>