More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12601 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  72.2 
 
 
222 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  72.2 
 
 
222 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  72.2 
 
 
222 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  72.25 
 
 
225 aa  329  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  70.48 
 
 
225 aa  322  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  55.17 
 
 
245 aa  254  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  51.77 
 
 
224 aa  218  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  48.47 
 
 
246 aa  214  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  52.27 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  51.14 
 
 
229 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  46.58 
 
 
237 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  48.89 
 
 
231 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  48.89 
 
 
234 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
238 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  49.55 
 
 
238 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  48.4 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  47.75 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  47.73 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  44.93 
 
 
225 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  43.67 
 
 
256 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.6 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  47.27 
 
 
231 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  45.37 
 
 
238 aa  181  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40.85 
 
 
232 aa  164  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 
212 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  38.36 
 
 
209 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 
206 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.45 
 
 
210 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
210 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.55 
 
 
207 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  36.94 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.49 
 
 
206 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  39.17 
 
 
201 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.5 
 
 
211 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 
205 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  39.25 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 
205 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 
209 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  39.25 
 
 
209 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.63 
 
 
214 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 
209 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 
209 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
198 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  38.32 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  38.32 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
209 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
209 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 
214 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  37.23 
 
 
224 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
209 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.79 
 
 
209 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
213 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  35.87 
 
 
230 aa  121  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 
213 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.91 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  34.68 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.67 
 
 
207 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  38.7 
 
 
210 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.65 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 
303 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
210 aa  118  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  35.65 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.87 
 
 
212 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  38.76 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.4 
 
 
215 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 
215 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 
209 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  34.7 
 
 
222 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.4 
 
 
215 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.24 
 
 
209 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.4 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  33.33 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 
214 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.94 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 
215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>