More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12585 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1159    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  35.25 
 
 		 1048 aa  246  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1065 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  30.86 
 
 		 581 aa  213  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  32.16 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 		 639 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  30.27 
 
 		 584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 577 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 		 598 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 748 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 624 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.72 
 
 		 597 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  27.23 
 
 		 621 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 594 aa  143  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  25.48 
 
 		 1588 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  33.67 
 
 		 1275 aa  123  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  29.37 
 
 		 335 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.74 
 
 		 253 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  38.14 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  39.44 
 
 		 323 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  31.25 
 
 		 252 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  31.67 
 
 		 310 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  32.2 
 
 		 252 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  37.78 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35.68 
 
 		 311 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  34.83 
 
 		 327 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.29 
 
 		 349 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.27 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  37.06 
 
 		 259 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.54 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.27 
 
 		 320 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.27 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.8 
 
 		 320 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  30.94 
 
 		 354 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.85 
 
 		 276 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.68 
 
 		 306 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  26.57 
 
 		 256 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.04 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.68 
 
 		 305 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.68 
 
 		 305 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.57 
 
 		 302 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.04 
 
 		 347 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.04 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.04 
 
 		 347 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.04 
 
 		 306 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.65 
 
 		 300 aa  97.8  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.93 
 
 		 263 aa  97.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  35.59 
 
 		 333 aa  97.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.14 
 
 		 311 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  24.41 
 
 		 310 aa  97.4  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.93 
 
 		 728 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  30.6 
 
 		 316 aa  97.4  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.51 
 
 		 318 aa  97.1  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.68 
 
 		 358 aa  97.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.98 
 
 		 302 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  30.41 
 
 		 316 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.98 
 
 		 302 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.03 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.85 
 
 		 740 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  28.98 
 
 		 308 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  27.81 
 
 		 345 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.33 
 
 		 327 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  29.36 
 
 		 335 aa  95.5  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.37 
 
 		 760 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  36.69 
 
 		 343 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29 
 
 		 738 aa  94.4  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  27.78 
 
 		 314 aa  94  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  29.9 
 
 		 352 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.52 
 
 		 263 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  31.5 
 
 		 327 aa  94  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.53 
 
 		 315 aa  93.6  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  28.81 
 
 		 311 aa  93.6  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  29.07 
 
 		 312 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.57 
 
 		 751 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.95 
 
 		 263 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2456  patatin  33.18 
 
 		 336 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30.36 
 
 		 707 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  28.72 
 
 		 321 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  27.48 
 
 		 312 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.25 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10170  FabD/lysophospholipase-like protein  33.88 
 
 		 329 aa  91.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3633  hypothetical protein  32.52 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43300  hypothetical protein  32.52 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.882188  normal  0.835077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  29.29 
 
 		 280 aa  91.3  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.55 
 
 		 275 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  29.97 
 
 		 348 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.95 
 
 		 263 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30 
 
 		 345 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  31.72 
 
 		 320 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  31.38 
 
 		 320 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  27 
 
 		 390 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.39 
 
 		 263 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.39 
 
 		 263 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  34.39 
 
 		 310 aa  90.5  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.81 
 
 		 748 aa  90.5  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  37.25 
 
 		 328 aa  90.5  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.57 
 
 		 727 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>