185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12583 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 349 aa  668    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  76.22 
 
 		 349 aa  534  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  25.87 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  19.69 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  25.12 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  25.12 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  25.12 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  25.12 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  19.73 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  24.63 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  24.88 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.71 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  21.34 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.99 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  22.42 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  23.27 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.71 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.44 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  24.75 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  23.42 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  22.93 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  22.93 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  23.68 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  21.84 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  22.65 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  22.03 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  25.07 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  24.29 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  24.93 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  23 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  38.89 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.34 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.34 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.59 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  24.14 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  19.58 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  21.35 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  19.5 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  19.5 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  20.17 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  23.26 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  34.17 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  22.28 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  23.77 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  23.14 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  21.27 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  24.11 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  25.26 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  34.48 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  20.91 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  21.99 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  33.62 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  27.06 
 
 		 849 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  23.61 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.05 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  22.77 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  26.98 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  27.87 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  19.33 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.51 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.67 
 
 		 849 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  24.45 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  24.94 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.51 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  21.28 
 
 		 885 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  30.23 
 
 		 787 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.54 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  25.66 
 
 		 411 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  23.42 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  20 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  26.67 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  25.41 
 
 		 779 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 852 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 856 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  19.37 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  29.32 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.88 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.99 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  20 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>