43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12537 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  832    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  29.97 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  26.85 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  31.73 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  26.55 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  30.23 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  25.49 
 
 		 419 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  27.64 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  27.61 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  22.12 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  26.21 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  27.32 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  26.3 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  27.18 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  24.66 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  28.1 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  27.3 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  46.91 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  25.49 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  29.31 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  22.4 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  33.06 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  25.64 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  34.04 
 
 		 156 aa  50.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.21 
 
 		 355 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  24.92 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  27.22 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  24.85 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.17 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  31.54 
 
 		 175 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.14 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  27.52 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  24.61 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  29.17 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  23.48 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  25.47 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  22.58 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  26.42 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.83 
 
 		 182 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  22.43 
 
 		 367 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>