19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12493 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12493  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.226542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4061  hypothetical protein  73.47 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3607  hypothetical protein  68.21 
 
 
161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3680  hypothetical protein  68.21 
 
 
161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950227  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3612  hypothetical protein  68.21 
 
 
161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2575  hypothetical protein  67.81 
 
 
158 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1395  hypothetical protein  41.72 
 
 
160 aa  121  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00858881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2034  hypothetical protein  46.43 
 
 
164 aa  111  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1141  hypothetical protein  38.26 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11860  protein of unknown function (DUF477)  38.27 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1545  protein of unknown function DUF477  41.59 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4628  hypothetical protein  33.64 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0203811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1827  hypothetical protein  40.68 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000185967  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3518  hypothetical protein  27.59 
 
 
132 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3893  hypothetical protein  26.72 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5307  hypothetical protein  41.11 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393038  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1380  hypothetical protein  28.3 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1159  hypothetical protein  30.97 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7328  hypothetical protein  32.97 
 
 
124 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>