More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12483 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
302 aa  598  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  68.86 
 
 
295 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  56.08 
 
 
320 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  47.99 
 
 
313 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  47.65 
 
 
315 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  46.33 
 
 
325 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  48.99 
 
 
316 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  47.32 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  45.61 
 
 
312 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  45.79 
 
 
311 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  42.19 
 
 
311 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  49.49 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  45.79 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  46.26 
 
 
325 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  48.81 
 
 
287 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  41.08 
 
 
314 aa  228  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  49.01 
 
 
303 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  53.31 
 
 
314 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  39.8 
 
 
310 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  37.62 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  29.3 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  31.7 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  26.69 
 
 
337 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  27.5 
 
 
305 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.36 
 
 
609 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.69 
 
 
816 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.82 
 
 
610 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.8 
 
 
610 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  26.37 
 
 
804 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  26.54 
 
 
418 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  26.07 
 
 
434 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  26.11 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.79 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  30.82 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  29.5 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  26.42 
 
 
629 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  29.5 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  25.16 
 
 
774 aa  86.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.63 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.34 
 
 
605 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.25 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  25.39 
 
 
381 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.79 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  29.56 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  31 
 
 
1226 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.19 
 
 
615 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  27.33 
 
 
1189 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  26.28 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  30.16 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  28.25 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  26.07 
 
 
1196 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  28.21 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.06 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  28.52 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  25.17 
 
 
768 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  24.52 
 
 
780 aa  79.3  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 
804 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.48 
 
 
813 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  24.43 
 
 
807 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4784  homocysteine S-methyltransferase  28.53 
 
 
643 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  26.05 
 
 
1224 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  26.75 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  30.23 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  27.41 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  24.6 
 
 
768 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  23.88 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.32 
 
 
614 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.04 
 
 
800 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.57 
 
 
612 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.53 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.68 
 
 
613 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.68 
 
 
613 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  24.57 
 
 
791 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.58 
 
 
605 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  28.88 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  29.71 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.16 
 
 
637 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.19 
 
 
818 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  29.22 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  28.75 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  27.61 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  26.83 
 
 
819 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  27.76 
 
 
1251 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  29.04 
 
 
801 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  26.86 
 
 
1224 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  32.03 
 
 
1220 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  23.99 
 
 
1208 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  27.79 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  32.03 
 
 
1264 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  32.03 
 
 
1264 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  23.13 
 
 
781 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  28.79 
 
 
1251 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  29.28 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  28.08 
 
 
811 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  27.02 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  26.82 
 
 
841 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  25.97 
 
 
1278 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  25.82 
 
 
1267 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>