More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12440 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
86 aa  161  2e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 
86 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 
86 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 
86 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  80.23 
 
 
86 aa  131  4e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 
86 aa  129  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  76.74 
 
 
86 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  75.58 
 
 
86 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  72.09 
 
 
86 aa  115  2e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  70.93 
 
 
88 aa  112  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 
86 aa  112  2e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 
90 aa  109  1e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  70.93 
 
 
86 aa  110  1e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  68.6 
 
 
92 aa  107  4e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  70.37 
 
 
88 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  70.37 
 
 
88 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  71.6 
 
 
89 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  70.89 
 
 
95 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  70.37 
 
 
86 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  66.28 
 
 
89 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  66.28 
 
 
86 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  69.14 
 
 
90 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  68.29 
 
 
107 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  73.33 
 
 
86 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 
86 aa  100  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  64.2 
 
 
88 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  72.09 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  68.83 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  63.86 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  66.28 
 
 
86 aa  94  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  59.3 
 
 
162 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  61.73 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 
86 aa  87  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  59.49 
 
 
167 aa  84.3  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  66.25 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
88 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  58.14 
 
 
172 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 
87 aa  82.8  1e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 
87 aa  82.8  1e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  54.65 
 
 
87 aa  81.6  3e-15  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
89 aa  72.4  2e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
89 aa  71.6  3e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 
95 aa  71.2  5e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  48.24 
 
 
105 aa  70.1  9e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  50.59 
 
 
89 aa  69.7  1e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 
88 aa  67.8  5e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
92 aa  65.5  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
92 aa  65.9  2e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
90 aa  63.5  8e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
90 aa  62.8  1e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
90 aa  62.8  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
90 aa  62.8  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
90 aa  62.8  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
90 aa  62.8  1e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.35 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
92 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
90 aa  62.4  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
87 aa  62.8  2e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  44.05 
 
 
88 aa  62.4  2e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  61.6  3e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  45.57 
 
 
100 aa  62  3e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
88 aa  61.6  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
96 aa  61.6  4e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
85 aa  61.6  4e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
92 aa  61.6  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
85 aa  61.2  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  60.5  7e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  60.1  9e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.77404e-11  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  59.7  1e-08  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.42728e-06  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.3085e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.55802e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.61385e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 
91 aa  59.3  2e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.98649e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.4189e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.78838e-09  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
85 aa  59.3  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
83 aa  58.9  2e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.06786e-06  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  59.3  2e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.0572e-06  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  8.72417e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
85 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
85 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
92 aa  58.9  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.13857e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.43906e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>