78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12376 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  100 
 
 
391 aa  725    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  62.56 
 
 
391 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  62.64 
 
 
760 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  61.05 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  38.46 
 
 
396 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  62.87 
 
 
580 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  61.58 
 
 
3295 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  40.05 
 
 
350 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  39.84 
 
 
470 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  55.81 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  52.15 
 
 
406 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  50.54 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  58.08 
 
 
655 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  38.05 
 
 
350 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  57.62 
 
 
443 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  61.54 
 
 
645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  52.6 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  40.67 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  37.18 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  41.36 
 
 
408 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  58.56 
 
 
3166 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  59.06 
 
 
403 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  56.82 
 
 
1457 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  39.51 
 
 
382 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  58.01 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  42.23 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  58.33 
 
 
582 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  58.33 
 
 
409 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  56.74 
 
 
975 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  60.47 
 
 
394 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  55.69 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  54.39 
 
 
423 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  60.26 
 
 
3787 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  56.83 
 
 
394 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  63.8 
 
 
2532 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  58.48 
 
 
1013 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  54.31 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  57.74 
 
 
479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  59.6 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  33.02 
 
 
346 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  57.96 
 
 
590 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  42.11 
 
 
443 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  42.11 
 
 
443 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  42.11 
 
 
443 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  33.14 
 
 
194 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  37.65 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  58.33 
 
 
636 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  38.93 
 
 
556 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  36.93 
 
 
445 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  39.76 
 
 
518 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  60.99 
 
 
647 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  42.17 
 
 
368 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  32.94 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  41.38 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  38.73 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  32.34 
 
 
173 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  42.59 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  42.17 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  53.63 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  37.67 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  37.5 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  40.4 
 
 
524 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  36.91 
 
 
536 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  38.79 
 
 
513 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  38.67 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  38 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  38 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  38 
 
 
525 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  30.54 
 
 
178 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  48.09 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  28.07 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  28.07 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  39.07 
 
 
496 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  29.41 
 
 
180 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  29.34 
 
 
176 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  52.73 
 
 
613 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  37.37 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  40.3 
 
 
77 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>