281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12350 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  307  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 146 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  68.03 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  34.85 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.17 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  38.74 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  35.51 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  46.27 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  43.28 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 135 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  33.09 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  34.04 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 219 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  33.59 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>